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実験医学 40巻 17号

発行元
羊土社
ISSN
0288-5514
ISSN（オンライン）
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バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選 知る・学ぶ・使う, バイオDX時代の羅針盤 序にかえて バイオデータベースとバイオインフォマティクスツールを知り, 学び, 使いこなし, 研究成果をつかむために
小野浩雅

実験医学 40 (17) 2679-2684, 2022.
  • アブストラクト： 従量制は110円（税込）、基本料金制は基本料金に含まれます。
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. 統合TV (TogoTV) - 生命科学分野の有用なデータベース・ウェブツールを探す, 学ぶ, 使う
小野浩雅
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)
実験医学 40 (17) 2694-2696, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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2. Integbioデータベースカタログ - 多種多様な生命科学分野のデータベースから目的に合ったサイトを探す
信定知江
国立研究開発法人科学技術振興機構NBDC事業推進部
実験医学 40 (17) 2697-2699, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. 生命科学系データベースアーカイブ - あのデータベースが, 丸ごとダウンロード可能に!
箕輪真理
科学技術振興機構NBDC事業推進部
実験医学 40 (17) 2700-2702, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. 生命科学のデータ分析のためのウェブツールFaDA
上坂一馬
名古屋大学生命農学研究科ゲノム情報機能学研究分野
実験医学 40 (17) 2703-2706, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. PlotsOfData - 箱ひげ図やバイオリンプロット, jitterプロットが簡単に描けるウェブツール
別所-上原学
名古屋大学高等研究院 / 名古屋大学大学院理学研究科
実験医学 40 (17) 2707-2710, 2022.
  • アブストラクト： 従量制は110円（税込）、基本料金制は基本料金に含まれます。
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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6. RStudio Cloud - オンラインでデータサイエンスを行い, 共有し, 教え, 学ぶ
鈴木治夫
慶應義塾大学環境情報学部
実験医学 40 (17) 2711-2713, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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7. Code Ocean - コード, データ, 計算環境をまるごと公開, 共有するサービス
露崎弘毅
理化学研究所生命機能科学研究センターバイオインフォマティクス研究開発チーム
実験医学 40 (17) 2714-2716, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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8. protocols.io - 研究手法のオープン化を加速するオンラインプラットフォーム
松尾禎之
関西医科大学附属生命医学研究所侵襲反応制御部門
実験医学 40 (17) 2717-2719, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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9. figshare - 研究に関するあらゆるデータを引用可能な形で公開する
田村啓太
広島大学大学院統合生命科学研究科
実験医学 40 (17) 2720-2723, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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10. バイオリソースデータベース or 生物遺伝資源データベース - 「リソースなくして研究なし」研究にバイオリソースを活用しよう
川本祥子
情報・システム研究機構国立遺伝学研究所
実験医学 40 (17) 2724-2727, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. PubMed - 生命科学分野の論文を検索
山本泰智
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2728-2730, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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2. CiNii Research - 論文や図書, 研究データを統合した学術検索基盤
大波純一, 天野晃
国立情報学研究所オープンサイエンス基盤研究センター
実験医学 40 (17) 2731-2734, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. 文献管理事はじめ
成川礼
東京都立大学大学院理学研究科生命科学専攻
実験医学 40 (17) 2735-2736, 2022.
  • アブストラクト： 従量制は110円（税込）、基本料金制は基本料金に含まれます。
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. Mendeley
成川礼
東京都立大学大学院理学研究科生命科学専攻
実験医学 40 (17) 2737-2738, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. Zotero
成川礼
東京都立大学大学院理学研究科生命科学専攻
実験医学 40 (17) 2739-2741, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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6. Paperpile
成川礼
東京都立大学大学院理学研究科生命科学専攻
実験医学 40 (17) 2742-2744, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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7. inMeXes - 生命科学分野の英語表現を高速, 軽快に検索
山本泰智
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2745-2747, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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8. Allie - 生命科学分野の略語を検索
山本泰智
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2748-2750, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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9. Colil - 生命科学分野の論文の引用情報を検索
山本泰智
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2751-2753, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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10. bioRxiv - 生命科学分野のプレプリントサーバー
坊農秀雅
広島大学ゲノム編集イノベーションセンター・大学院統合生命科学研究科 / ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2754-2756, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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11. DeepLとGrammarlyを使って最速で英文を執筆する - 無料の翻訳 / 英文校正サービスを使って高品質な英文を作成する
井内仁志
早稲田大学理工学術院
実験医学 40 (17) 2757-2759, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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12. Togo picture gallery - 誰でも自由に使える生命科学分野のイラスト集
小野浩雅
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)
実験医学 40 (17) 2760-2762, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. NCBI Genome Data Viewer - さまざまな生物種のゲノム情報を視覚的に検索 / 解析する
鈴木貴之1), 坊農秀雅2)3)
1)広島大学大学院統合生命科学研究科, 2)広島大学ゲノム編集イノベーションセンター・大学院統合生命科学研究科, 3)ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2763-2765, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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2. UCSC Genome Browser - ゲノム地図とその周辺情報の可視化とその豊富なツールたち
森岡勝樹
理化学研究所生命医科学研究センター生命医科学大容量データ技術研究チーム
実験医学 40 (17) 2766-2769, 2022.
  • アブストラクト： 従量制は110円（税込）、基本料金制は基本料金に含まれます。
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. Ensembl Genome Browser - 膨大な情報が織りなす最新の「アンサンブル」を一覧できるゲノムブラウザ
仲地ゆたか
熊本大学大学院生命科学研究部分子脳科学講座
実験医学 40 (17) 2770-2773, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. Plant GARDEN - さまざまな植物のゲノムやマーカー情報を集めたポータルサイト
磯部祥子, 市原寿子, 平川英樹
公益財団法人かずさDNA研究所
実験医学 40 (17) 2774-2776, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. Microbiome DatahubとPZLAST - マイクロバイオームの統合データベースおよび配列類似性検索ツール
森宙史
情報・システム研究機構国立遺伝学研究所情報研究系
実験医学 40 (17) 2777-2779, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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6. NCBI RefSeq - 標準となる塩基配列およびアミノ酸配列の包括的なデータセット
内藤雄樹
ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2780-2782, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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7. GGRNA - あらゆるキーワードから遺伝子を検索
内藤雄樹
ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2783-2785, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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8. NCBI BLAST - 塩基配列またはアミノ酸配列の検索
内藤雄樹
ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2786-2788, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
download全文ダウンロード(3.02MB)
9. GGGenome - 高速で見落としのない塩基配列の検索ツール
内藤雄樹
ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2789-2791, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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10. Sequence Read Archive (SRA) - 次世代シークエンサーから出力された生データを探す・使う
児玉悠一
情報・システム研究機構国立遺伝学研究所生命情報・DDBJセンター
実験医学 40 (17) 2792-2794, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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11. Digital Expression Explorer 2 - 解析済みRNA-seqデータ公開サービス
大田達郎
ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2795-2797, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. CRISPRdirect - ゲノム編集のためのガイドRNA設計ツール
内藤雄樹
ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2798-2800, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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2. CRISPOR - CRISPR-Cas9によるゲノム編集をデザインする
中前和恭
プラチナバイオ株式会社 / 広島大学ゲノム編集イノベーションセンター
実験医学 40 (17) 2801-2803, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. inDelphi - ゲノム編集で発生するインデルを予測する
中前和恭
プラチナバイオ株式会社 / 広島大学ゲノム編集イノベーションセンター
実験医学 40 (17) 2804-2806, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. PrimeDesign - Prime Editingによる精密ゲノム編集をデザインする
中前和恭
プラチナバイオ株式会社 / 広島大学ゲノム編集イノベーションセンター
実験医学 40 (17) 2807-2809, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. TIDE - ゲノム編集で発生するインデルを簡易解析する
中前和恭
プラチナバイオ株式会社 / 広島大学ゲノム編集イノベーションセンター
実験医学 40 (17) 2810-2812, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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6. CRISPResso2 - ゲノム編集サンプルのNGS解析を行う
中前和恭
プラチナバイオ株式会社 / 広島大学ゲノム編集イノベーションセンター
実験医学 40 (17) 2813-2815, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. UniProt - タンパク質を入り口とする, 生命科学の統合データベース
畠中秀樹
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2816-2818, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
download全文ダウンロード(2.75MB)
2. jPOST - アジア・オセアニアで最も有用なプロテオームデータベース : jPOSTを使ってプロテオーム解析をする
荒木令江
熊本大学大学院生命科学研究部腫瘍医学講座
実験医学 40 (17) 2819-2823, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
download全文ダウンロード(5.06MB)
3. PDBj - タンパク質構造データの日本語ポータルサイト
栗栖源嗣
大阪大学蛋白質研究所
実験医学 40 (17) 2824-2826, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. Molmil - ウェブベースの分子ビューア
Gert-Jan Bekker1), 川端猛2), 栗栖源嗣1)
1)大阪大学蛋白質研究所, 2)東北大学大学院情報科学研究科
実験医学 40 (17) 2827-2829, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. HOMCOS - タンパク質の結合立体構造の検索とモデリング
川端猛
東北大学大学院情報科学研究科
実験医学 40 (17) 2830-2833, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
download全文ダウンロード(4.10MB)
6. AlphaFoldDB - タンパク質の予測立体構造のデータベース
川端猛
東北大学大学院情報科学研究科
実験医学 40 (17) 2834-2837, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. TogoID - 生命科学データベースのID関係を検索し変換する
池田秀也
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2838-2840, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
download全文ダウンロード(2.59MB)
2. NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) - 公開されている遺伝子発現情報の生データを検索, 取得, 解析する
小野浩雅
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)
実験医学 40 (17) 2841-2844, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. Expression Atlas - 可視化された公共遺伝子発現データを探索する
池田秀也
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2845-2847, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. ChIP-Atlas 2.0 - 転写制御機構 & エピゲノムランドスケープを可視化する
鄒兆南, 沖真弥
京都大学大学院医学研究科創薬医学講座
実験医学 40 (17) 2848-2851, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. DAVID - シンプル, しかし幅広い生物で遺伝子セットの機能を知る
仲里猛留
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2852-2855, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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6. Metascape - モデル生物でのエンリッチメント解析結果をさまざまなビューでグラフィカルに表示
仲里猛留
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用機関施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2856-2860, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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7. Enrichr - さまざまな種類のデータベースに対してエンリッチメント解析
仲里猛留
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター
実験医学 40 (17) 2861-2863, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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8. BioCyc - ゲノムデータとパスウェイネットワークから総合的に生物を理解する
奥田修二郎
新潟大学医学部メディカルAIセンター
実験医学 40 (17) 2864-2866, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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9. Reactome - パスウェイデータを自由自在に活用し研究の幅を拡張する
奥田修二郎
新潟大学医学部メディカルAIセンター
実験医学 40 (17) 2867-2869, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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10. iDEP, BioJupies, RaNA-seq - ウェブブラウザで完結するRNA-seq解析ツール
安水良明
大阪大学免疫学フロンティア研究センター実験免疫学
実験医学 40 (17) 2870-2874, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. PubChem - 化合物とそれに関与する遺伝子, パスウェイなどの情報をフリーで提供
櫛田達矢
国立研究開発法人理化学研究所バイオリソース研究センター統合情報開発室
実験医学 40 (17) 2875-2877, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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2. ChEMBL - 手動でキュレーションされた生物活性分子のデータベース
山田一作
公益財団法人野口研究所
実験医学 40 (17) 2878-2880, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. HMDB (Human Metabolome Database) - ヒト代謝物のメタデータを取得する
津川裕司1), 岡昂輝2)
1)東京農工大学グローバルイノベーション研究院, 2)東京農工大学生命工学科
実験医学 40 (17) 2881-2883, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. MetaboAnalyst - メタボロームデータを可視化, 分析する
津川裕司1), 岡昂輝2)
1)東京農工大学グローバルイノベーション研究院, 2)東京農工大学生命工学科
実験医学 40 (17) 2884-2887, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. GlyCosmos - 糖鎖関連情報のアクセスと活用
藤田晶大1)2), 細田正恵2), 木下フローラ聖子1)2)
1)創価大学理工学部共生創造理工学科, 2)創価大学糖鎖生命システム融合研究所
実験医学 40 (17) 2888-2890, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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1. dbSNP - 一塩基多型の網羅的なデータベース
三輪華子, 大橋順
東京大学大学院理学系研究科
実験医学 40 (17) 2891-2893, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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2. gnomAD - 世界最大規模のヒトゲノムバリエーションデータベース
三嶋博之
長崎大学原爆後障害医療研究所人類遺伝学研究分野
実験医学 40 (17) 2894-2897, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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3. ClinVar - 遺伝子型と表現型を比較しながらバリアントの病原性を解釈する
丹羽諒1)2), 井本逸勢3)
1)京都大学医学研究科, 2)京都大学iPS細胞研究所, 3)愛知県がんセンター研究所
実験医学 40 (17) 2898-2900, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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4. DECIPHER - 世界中から登録された神経発達症例データベース : マイクロアレイ検査の強い味方
森貞直哉
兵庫県立こども病院臨床遺伝科
実験医学 40 (17) 2901-2904, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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5. GWAS Catalog - 既報のGWAS・GWAS関連多型のデータベース
寺尾知可史
理化学研究所生命医科学研究センターゲノム解析応用研究チーム
実験医学 40 (17) 2905-2907, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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6. PolyPhen-2 - 進化的保存性とタンパク質構造を考慮したアミノ酸置換のアノテーション
才津浩智
浜松医科大学医学科医化学講座
実験医学 40 (17) 2908-2910, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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7. DBKERO - 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈をめざした多階層オミクス統合データベース
鹿島幸恵1), 鈴木絢子1), 中井謙太2), 鈴木穣1)
1)東京大学新領域創成科学研究科, 2)東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター機能解析イン・シリコ分野
実験医学 40 (17) 2911-2914, 2022.
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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DBやツールの専門家による情報収集ルーティーンと取捨選択ノウハウ
小野浩雅
情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)
実験医学 40 (17) 2915-2917, 2022.
  • アブストラクト： 従量制は110円（税込）、基本料金制は基本料金に含まれます。
  • 全文ダウンロード： 従量制、基本料金制の方共に1,243円(税込) です。
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