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Genes & Genetic Systems 90巻 6号

発行元
日本遺伝学会
ISSN
1341-7568
ISSN（オンライン）
1880-5779
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巻
号
開始頁
Hypoxia up-regulates mitochondrial genome-encoded transcripts in Arabidopsis roots
Muhammad Waqar Hameed
Dr. Panjwani Center for Molecular Medicine and Drug Research, ICCBS, University of Karachi, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology
Genes & Genetic Systems 90 (6) 325-334, 2015.
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Effects of postnatal alcohol exposure on hippocampal gene expression and learning in adult mice
Dong Hoon Lee, Jihye Moon, Jinhyun Ryu, Joo Yeon Jeong, Gu Seob Roh, Hyun Joon Kim, Gyeong Jae Cho, Wan Sung Choi, Sang Soo Kang
Department of Anatomy & Convergence Medical Science, Institute of Health Sciences, School of Medicine, Gyeongsang National University
Genes & Genetic Systems 90 (6) 335-342, 2015.
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Gene discovery for facioscapulohumeral muscular dystrophy by machine learning techniques
Felix F.Gonzalez-Navarro1, Lluis A.Belanche-Munoz2, Maria G.Gamez-Moreno1, Brenda L.Flores-Rios1, Jorge E.Ibarra-Esquer3, Gabriel A.Lopez-Morteo1
1Instituto de Ingenieria, Universidad Autonoma de Baja California, 2Dept. de Ciencies de la Computacio, Universitat Politecnica de Catalunya - Barcelona Tech, 3Facultad de Ingenieria Universidad Autonoma de Baja California
Genes & Genetic Systems 90 (6) 343-356, 2015.
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S-1 Evolution of cancer genomes
LI, Wen-Hsiung1,2
1Biodiversity Research Center, Academia Sinica, 2Dept. Ecology and Evolution, Univ. Chicago
Genes & Genetic Systems 90 (6) 359-359, 2015.
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S-2 Revealing the time-dependent evolution of the hepatitis B virus from a chain of sequentially infected chronic carriers
WANG, Hurng-Yi1
1Graduate Inst. Clinical Med., National Taiwan Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 359-359, 2015.
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S-3 Population history before and after the transition from hunter-gatherer to agriculturist in Africa and Southeast Asia
KIM, Hie Lim1
1Nanyang Technological Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 359-359, 2015.
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S-4 Living on the edge - Mangrove genomes reveal severe adaptive strategies and hint at an uncertain future
SHI, Suhua1
1State Key Lab. Biocontrol, Grad. Sch. Life Sci.s, Sun Yat-Sen Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 359-359, 2015.
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S-5 Big-Data analysis used NGS and study of evolution
IKEO, Kazuho1,2
1Lab. DNA Data Analysis, Natl. Inst. Genet., 2Dept. Genet., SOKENDAI
Genes & Genetic Systems 90 (6) 360-360, 2015.
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PL-1 The H3K27 demethylase, Jmjd3, is essential for activation of pax6 during eye development
KAWAGUCHI, Akane1
1Dept. Animal Biosci., Nagahama Inst. Bio-Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 360-360, 2015.
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PL-2 Ser7 phosphorylation of RNAPII-CTD ensures on-chromatin retention of nascent ncRNAs, facilitating establishment and epigenetic inheritance of RNAi-depnendent heterochromatin formation
KAJITANI, Takuya1,2, KATO, Hiroaki3, CHIKASHIGE, Yuji4, HIRAOKA, Yasushi5, KIMURA, Hiroshi6, OHKAWA,Yasuyuki7, NAGAO, Koji8, OBUSE, Chikashi8, HERMAND, Damien9, MURAKAMI, Yota1
1Lab. Bioorganicchemistry, Grad. Sch. Sci., Hokkaido Univ., 2Grad. Sch. Med., Kyoto Univ., 3Grad. Sch. of Med. Res., Shimane Univ., 4Advanced ICT Res. Inst., National Inst. Inform. and Communications Tech., 5Grad. Sch. Frontier BioSci., Osaka Univ., 6Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech., 7Grad. Sch. Med. Sci., Kyushu Univ., 8Faclt. Adv. Lifescience, Hokkaido Univ., 9Namur Adv. Research College, Namur Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 360-360, 2015.
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PL-3 Direct estimation of genome-wide mutation rate in a chimpanzee family trio by ultra deep whole genome sequencing
GO, Yasuhiro1,2, TATSUMOTO, Shoji1,2, FUKUTA, Kentaro3, NOGUCHI, Hideki4, HAYAKAWA, Takashi5,6, TOMONAGA, Masaki5,7, HIRAI, Hirohira8, MATSUZAWA, Tetsuro5,6,7, AGATA, Kiyokazu9,10, FUJIYAMA, Asao3,4
1Dept. Brain Sci.s, Center for Novel Sci. Initiatives, Natl. Inst. Natural Sci., 2Div. Behavioral Dev., Natl. Inst. Physiological Sci., 3Comparative Genomics Lab., Natl. Inst. Genet., 4Adv. Genomics Center, Natl. Inst. Genet., 5Dept. WildLife Sci. (Nagoya Railroad Co.,Ltd.), Primate Res. Inst., Kyoto Univ., 6Japan Monkey Centre, 7Language and Intelligence Section, Dept. Cognitive Sci.s, Primate Res. Inst., Kyoto Univ., 8Molec. Biol. Section, Dept. Cellular and Molec. Biol., Primate Res. Inst., Kyoto Univ., 9Lab. Biodiversity, Global COE Program, Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ., 10Lab. Molec. Dev. Biol., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 361-361, 2015.
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WS1-1 Insertion of an early transposon induced ectopic expression of the Ptf1a gene in the Danforth's short tail (Sd) mice
ARAKI, Kimi1, SEMBA, Kei1, NAKAHARA, Mai1, ABE, Kuniya2, ARAKI, Masatake1, YAMAMURA, Ken-ichi1
1Kumamoto Univ., Inst. Resource Dev. and Analysis, 2RIKEN BioResouce Center
Genes & Genetic Systems 90 (6) 361-361, 2015.
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WS1-2 Molecular analysis of autoinflammatory diseases using mouse models from ENU mutagenesis
ABE, Koichiro1, NUNOMURA, Satoshi2, RA, Chisei2, TAJIMA, Atsushi3
1Tokai Univ. Sch. Med., 2Nihon University Sch. Med., 3Kanazawa Univ. Grad. Sch. of Med. Sci.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 361-361, 2015.
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WS1-3 Reverse genetic studies for mitochondrial DNA-based diseases
NAKADA, Kazuto1
1Faclt. Life and Env. Sci.s, Univ. Tsukuba
Genes & Genetic Systems 90 (6) 362-362, 2015.
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WS1-4 A genome-editing approach using the CRISPR/Cas9 system reveals the cis-regulatory landscape of the mouse Shh locus
AMANO, Takanori1
1Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 362-362, 2015.
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WS1-5 Identification of skin cancer resistance / susceptibility gene using two-stage skin cancer mouse model
OKUMURA, Kazuhiro1, SAITO, Megumi1, YOSHIZAWA, Yasuhiro1, ISOGAI, Eriko1, WAKABAYASHI, Yuichi1
1Dept. Carcinogenesis Res., Div. Experimental Animal Res., Chiba Cancer Center Res. Inst.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 362-362, 2015.
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WS2-1 Identifying genes responsible for hybrid inviability and sterility in Drosophila
SAWAMURA, Kyoichi1, HAYASHI, Takaaki2, MIURA, Kohei2, ARAYE, Quenta2
1Faclt. Life and Env. Sci.s, Univ. Tsukuba, 2Grad. Sch. Life and Env. Sci., Univ. Tsukuba
Genes & Genetic Systems 90 (6) 363-363, 2015.
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WS2-2 The mechanism controlling the development of sexually-dimorphic neurons in Drosophila
ITO, Hiroki1
1Div. Neurogenetics, Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 363-363, 2015.
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WS2-3 A molecular mechanism underlying planar cell polarity orientation in Drosophila
YAMAZAKI, Masakazu1,2, AYUKAWA, Tomonori1,2, AKIYAMA, Masakazu3, SENOO, Haruki1
1Dept. Cell Biol. and Morphology, Akita Univ. Grad. Sch. Med., 2Res. Center for Biosignal, Akita Univ., 3Res. Inst. Electron. Sci., Hokkaido Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 363-363, 2015.
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WS2-4 Prospects for genome engineering in Drosophila melanogaster
KONDO, Shu1
1Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 363-363, 2015.
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WS2-5 E3 ligase Sherpa is required for the activation of the Toll pathway in Drosophila adults
KURAISHI, Takayuki1
1Dept. MicroBiol. and Immun., Keio Univ. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 364-364, 2015.
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WS3-1 Multiple mechanisms regulating nucleotide lesions - overview -
UMEZU, Keiko1, HAYASHI, Michio1
1Section of Biochem., Fukuoka Dental College
Genes & Genetic Systems 90 (6) 364-364, 2015.
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WS3-2 How does oxidative mutation come from?
NUNOSHIBA, Tatsuo1
1College of Liberal Arts, InterNatl. Christian Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 364-364, 2015.
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WS3-3 Spontaneous mutagenesis caused by oxidative damage of DNA and nuceotide pool
MAKI, Hisaji1
1Grad. Sch. Biol. Sci., Nara Inst. Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 365-365, 2015.
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WS3-4 Two ways to escape from the threat of mutagenic nucleotides
SEKIGUCHI, Mutsuo1, ITO, Riyoko1, SEKIGUCHI, Takeshi2, HAYAKAWA, Hiroshi1, INOKUCHI, Hachiro1
1Fukuoka Dental College, 2Kyushu Univ., Grad. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 365-365, 2015.
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WS3-5 Human DNA endonuclease V is a ribonuclease specific for inosine-containing RNA
KURAOKA, Isao1
1Grad. Sch. Eng. Sci., Osaka Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 365-365, 2015.
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WS4-1 Establishment of a novel animal model of ALS/FTD expressing G4C2 repeat RNA in Drosophila
UEYAMA, Morio1, ISHIGURO, Taro1,2, FUJIKAKE, Nobuhiro1, KONNO, Takuya3, KOYAMA, Akihide3, ONODERA, Osamu3, WADA, Keiji1, NAGAI, Yoshitaka1
1Dept. Degenerative Neurological Diseases, Natl. Inst. NeuroSci., Natl. Cent. of Neurology and Psychiatry, 2Dept. Neurology and Neurological Sci., Tokyo Medical and Dental Univ., 3Dept. Neurology, Brain Res. Inst., Niigata Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 366-366, 2015.
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WS4-2 Visualizing neural activities that underlie courtship following in Drosophila
KOHATSU, Soh1, YAMAMOTO, Daisuke1
1Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 366-366, 2015.
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WS4-3 Suppression of dopamine neurons for memory formation
YAMAGATA, Nobuhiro1, HIROI, Makoto2, KONDO, Shu3, ABE, Ayako1, TABATA, Tetsuya2, TANIMOTO, Hiromu1
1Tohoku Univ. Grad. Sch. Life Sci., 2The Univ. Tokyo, Inst. Molec. and Cell. BioSci., 3Natl. Inst. Genet., Mishima
Genes & Genetic Systems 90 (6) 366-366, 2015.
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WS4-4 Remodeling of glial assembly in Drosophila brain during metamorphosis
AWASAKI, Takeshi1, KATO, Kentaro1
1Dept. Biol., Kyorin Univ. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 366-366, 2015.
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WS4-5 A combinational role of the two protein tyrosine phosphatases, Lar and Ptp69D, in the photoreceptor axon targeting
HAKEDA-SUZUKI, Satoko1, TAKECHI, Hiroki1, SUZUKI, Takashi1
1Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 367-367, 2015.
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WS5-1 Mechanisms how ORC recognizes chromosomal replication origins in budding yeast
KAWAKAMI, Hironori1, KAWANISHI, Tomohito1, OHASHI, Eiji2, KANAMOTO, Shota1, TSURIMOTO, Toshiki2, KATAYAMA, Tsutomu1
1Dept. Molec. Biol., Grad. Sch. Pharm. Sci.s, Kyushu Univ., 2Dept. Biol., Sch. Sci.s, Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 367-367, 2015.
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WS5-2 Identification of division of labour among replicative DNA polymerases at genome-wide level
DAIGAKU, Yasukazu1, KESZTHELYI, Andrea2, MIYABE, Izumi2, CARR, Antony M.2
1Frontier Res. Inst. for Interdisciplinary Sci.s Tohoku Univ., 2Genome Damage and Stability Centre Univ. Sussex
Genes & Genetic Systems 90 (6) 367-367, 2015.
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WS5-3 Estimation of germline mutation rate by using mutation accumulation mouse lines
UCHIMURA, Arikuni1, HIGUCHI, Mayumi1, NIIMI, Eri1, MINAKUCHI, Yohei2, TOYODA, Atsushi2, FUJIYAMA, Asao2, NISHINO, Jo3, YAGI, Takeshi1
1Grad. Sch. Front. BioSci., Osaka Univ., 2Comparative Genomics Lab., Natl. Inst. Genet., 3Dept. Biostatistics, Nagoya Univ. Grad. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 368-368, 2015.
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WS5-4 Biochemical analysis reveals a novel action of bacterial Mre11/Rad50 complex
FURUKOHRI, Asako1,2, LIM, Chew Theng1,2, LAI, Pey Jiun1,2, LEACH, David R.F.1,2, MAKI, Hisaji1,2
1Div. Systems Biol., Grad. Sch. Biol. Sci., Nara Inst. Sci. Tech., 2Inst. Cell Biol., Sch. Biol. Sci.s, Univ. Edinburgh
Genes & Genetic Systems 90 (6) 368-368, 2015.
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WS5-5 Stimulation of human DNA polymerase η by PCNA
MASUDA, Yuji1,2, KANAO, Rie1, MASUTANI, Chikahide1
1Dept. Genome Dynamics, Res. Inst. of Env. Medicine, Nagoya Univ., 2Dept. Toxicogenomics, Nagoya Univ. Grad. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 368-368, 2015.
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WS5-6 Posession of CENP-B box by centromeric repetitive DNA is likely to be more common than currently supposed
SUNTRONPONG, Aorarat1, KUGOU, Kazuto2, MASUMOTO, Hiroshi2, KOGA, Akihiko1
1Primate Res. Inst., Kyoto Univ., 2Dept. Frontier Res., Kazusa DNA Res. Inst.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 368-368, 2015.
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WS7-1 LTR promoters activated in stem cells and tumor cells
KOSUKE, Hashimoto1, CARNINCI, Piero1
1RIKEN Center for Life Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 369-369, 2015.
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WS7-2 Transcriptional regulation of monoallelically expressed genes in ground-state embryonic stem cells
OHISHI, Hiroaki1, UNOKI, Motoko1, FUKUDA, Kei2, MAENOHARA, Shoji1, HORI, Kyohei1, CHIBA, Hatsune4, SADO, Takashi1,3, SASAKI, Hiroyuki1
1Div. Epigenomics and Dev., Med. Inst. Bioregulation, Kyushu Univ., 2Cellular Memory Lab., RIKEN, 3Lab. Epigenetics and Dev., Dept. Adv. Biosci., Grad. Sch. Agr., Kinki Univ., 4Dept. Informative Genetics, Environment and Genome Res. Center, Tohoku Univ. Grad. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 369-369, 2015.
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WS7-3 Epigenetic diversity on human LINE1 promoters in cancer cells
ISHIGURO, Koichi1, AIZAWA, Yasunori1
1Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 369-369, 2015.
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WS7-4 Totipotent-like features are induced by downregulating replication-dependent chromatin assembly
ISHIUCHI, Takashi1,2, ENRIQUEZ-GASCA, Rocio3, MIZUTANI, Eiji4, WAKAYAMA, Teruhiko4, VAQUERIZAS, Juan M3, TORRES-PADILLA, Maria Elena1
1IGBMC, 2Med. Inst. Bioregulation, Kyushu Univ., 3Max Planck Institute for Molecular Biomedicine, 4Faclt. Life and Environmental Sciences, Univ. Yamanashi
Genes & Genetic Systems 90 (6) 369-369, 2015.
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WS7-5 Silencing of endogenous retroviruses (ERVs) mediated by Setdb1
KATO, Masaki1, TAKEMOTO, Keiko2, TAN, SiokLay2, KAGEYAMA, Ryoichiro2, SHINKAI, Yoichi1
1Cellular memory lab., RIKEN
Genes & Genetic Systems 90 (6) 370-370, 2015.
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WS8-1 Highly conserved RNA secondary structures predicted in the packaging signals of influenza A virus segments
KOBAYASHI, Yuki1
1Nihon Univ. Veterinary Res. Center
Genes & Genetic Systems 90 (6) 370-370, 2015.
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WS8-2 Genome bundling and packaging of Influenza A virus
GOTO, Hideo1
1Wakayama Med. Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 370-370, 2015.
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WS8-3 Rotavirus structural protein interaction regulates rotavirus genome reassortment
FUJII, Yoshiki1, HAGA, Kei1, DOAN, Yen Hai1, KATAYAMA, Kazuhiko1
1Dept. Vriology II, Natl. Inst. Infectious Dis.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 371-371, 2015.
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WS8-5 A possible packaging signal in the rotavirus genome
SUZUKI, Yoshiyuki1
1Grad. Sch. Natural Sci., Nagoya City Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 371-371, 2015.
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WS9-1 Spatiotemporal gene expression trajectory in the human and non-human ape brains
GO, Yasuhiro1,2, TATSUMOTO, Shoji1,2, LI, Qian3, OISHI, Takao4, UDONO, Toshifumi5, SHIGENOBU, Shuji6, KAKITA, Akiyoshi7, NAWA, Hiroyuki7, KHAITOVICH, Philipp3
1Dept. Brain Sci.s, Center for Novel Sci. Initiatives, Natl. Inst. Natural Sci., 2Div. Behavioral Dev., Natl. Inst. Physiological Sci., 3CASMPS Partner Inst. Computational Biol., Shanghai Inst. of Biol. Sci.s of Chinese Acad. of Sci., 4Primate Res. Inst., Kyoto Univ., 5Wildlife Res. Center of Kyoto Univ., 6Nati. Inst. Basic Biol., 7Brain Res. Inst., Niigata Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 372-372, 2015.
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WS9-2 Evolution of duplicated genes retained after whole genome duplications and its relationship with human diseases
MAKINO, Takashi1, MCLYSAGHT, Aoife2
1Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ., 2Trinity College, Smurfit Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 372-372, 2015.
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WS9-3 Genome duplications and vertebrate evolution : rapid genome reshaping with chromosomal block loss suggested by phylogenomic comparative approach
SATO, Yukuto1, INOUE, Jun2, SINCLAIR, Robert2, TSUKAMOTO, Katsumi3, NISHIDA, Mutsumi4
1Dept. Inst. Genomics, Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku Univ., 2Mathematical Biol. Unit, Okinawa Inst. Sci. Tech. Graduate Univ., 3College of Bioresource Sci., Nihon Univ., 4Univ. of the Ryukyus
Genes & Genetic Systems 90 (6) 372-372, 2015.
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WS9-4 Micro population structure in Homo sapiens - in terms of Genome Anthropology
OOTA, Hiroki1
1Kitasato Univ. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 372-372, 2015.
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WS10-1 Coevolution of DNA methylation and DNA sequences
TAKUNO, Shohei1
1SOKENDAI (Grad. Univ. Adv. Stud.)
Genes & Genetic Systems 90 (6) 373-373, 2015.
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WS10-2 For the identification of the molecular mechanism of heterosis by epigenetic approach in Brassica
KAWANABE, Takahiro1, FUJIMOTO, Ryo1
1Grad. Sch. Agr. Sci., Kobe Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 373-373, 2015.
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WS10-3 Genome-wide negative feedback system for transgenerational dynamics of DNA methylation in Arabidopsis
ITO, Tasuku1, TARUTANI, Yoshiaki1, TO, Taiko Kim1, TAKASHIMA, Kazuya1, SAZE, Hidetoshi2, TOYODA, Atsushi3, FUJIYAMA, Asao3, KAKUTANI, Tetsuji1
1Dept. Integrated Genetics, Natl. Inst. Genet., 2Okinawa Inst. Sci. Tech., 3Center for Inform. Biol., Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 373-373, 2015.
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WS10-4 Origin and evolution of genomic imprinting in mammals
SUZUKI, Shunsuke1,2
1Dept. Epigenomics, Frontier AgriSci. Tech. Center, Faclt. Agr., Shinshu Univ., 2Dept. Interdisciplinary Genome Sci.s and Cell Metabolism, Inst. Biomedical Sci.s, Interdisciplinary Cluster for Cutting Edge Res., Shinshu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 373-373, 2015.
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WS10-5 Epigenomic evolution of primate germ cells
FUKUDA, K.1,2, ICHIYANAGI, K.2, NAGANO, M.3, YANAGAWA, Y.3, TAKAESU, N.4, IMAI, H.5, SASAKI, H.2
1Div. of Cellular Memory, RIKEN, 2Div. of Epigenomics and Dev., Med. Inst. Bioreg., Kyushu Univ., 3Lab. Theriogenology, Grad. School Vet. Med., Hokkaido Univ., 4Maruyama Zoo, 5Dept. Cell. Mol. Biol., Prim. Res. Inst., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 374-374, 2015.
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WS11-1 Analysis of epigenetic marks on plant chromosomes - from micro to macro -
NAGAKI, Kiyotaka1, YAMAJI, Naoki1, TANAKA, Keisuke2, KOBAYASHI, Hisato2, MURATA, Minoru1
1Inst. Plant Sci. and Resources, Okayama Univ., 2NODAI Genome Res. Center, Tokyo Univ. Agr.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 374-374, 2015.
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WS11-2 Good job, FISH! The time has come for chromatin-visualization with genome editing
MATSUNAGA, Sachihiro1, HIRAKAWA, Takeshi1, FUJIMOTO, Satoru1
1Dept. Applied Biol. Sci., Fac. Sci. and Tech., Tokyo Univ. Sci.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 374-374, 2015.
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WS11-3 Traveling salesman problem based mapping approach for a huge plant Y chromosome
KAZAMA, Yusuke1, ISHII, Kotaro1, KAWANO, Shigeyuki2, ABE, Tomoko1
1RIKEN Nishina Center, 2Dept. Integr. BioSci.s, Grad. Sch. Front. Sci.s, Univ. Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 375-375, 2015.
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WS11-4 How to loss the Y chromosome in Y-absent mammals
KUROIWA, Asato1
1Dept. Biol. Sci., Faclt. Sci., Hokkaido Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 375-375, 2015.
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WS11-5 Diversity of the sex chromosomes in medaka fishes
MYOSHO, Taijun1, SAKAIZUMI, Mitsuru1
1Inst. Sci. Tech., Niigata Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 375-375, 2015.
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WS11-6 Now and past contribution of CYTOLOGIA first published in 1929 to the progress of cytogenetics
KAWANO, Shigeyuki1
1Plant life system, Dept. Integr. BioSci.s, Grad. Sch. Front. Sci.s, Univ. Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 375-375, 2015.
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WS12-1 Loss and alteration in rRNA-mRNA interaction during bacterial and plastid evolution
LIM, Kyungtaek1,2, FURUTA, Yoshikazu1,2, NAKAI, Kenta1,2, KOBAYASHI, Ichizo1,2
1Dept. Computational Biol. and Med. Sci., Univ. Tokyo, 2Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 376-376, 2015.
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WS12-2 Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome
ANDA, Mizue1,2, OHTSUBO, Yoshiyuki3, OKUBO, Takashi1, SUGAWARA, Masayuki1, NAGATA, Yuji3, TSUDA, Masataka3, MINAMISAWA, Kiwamu1, MITSUI, Hisayuki1
1Lab. Env. microBiol., Grad. Sch. life Sci., Tohoku Univ., 2Dept. Infection Metagenomics, Res. Inst. Microb. Dis., Osaka Univ., 3Lab. Microbial Genet. and Genomics, Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 376-376, 2015.
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WS12-3 Evolution driven by methytlome changes
YANO, Hirokazu1,2, FURUTA, Yoshikazu1,2, ALAM, Zobaidul M.1, RIMBARA, Emiko3, NAMBA-FUKUYO, Hiroe1, SHIBATA, Tomoko4, NISHIYAMA, Tomoaki5, SHIGENOBU, Shuji4, HASEBE, Mitsuyasu4, SUZUKI, Yutaka1, SUGANO, Sumio1,2, SHIBAYAMA, Keigo3, KOBAYASHI, Ichizo1,2
1Grad. Sch. Front. Sci.s, 2Inst. Med. Sci., The Univ. Tokyo, 3Dept. Bacteriology II, Natl. Inst. Infectious Dis., 4Dept. Basic Biol., Sch. Life Sci., Grad. Univ. Adv. Stud., 5Adv. Sci. Res. Cent., Kanazawa Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 376-376, 2015.
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WS12-4 Rice-Magnaporthe interactions : molecular mechanisms and co-evolution
TERAUCHI, Ryohei1
1Iwate BioTech. Res. Cent.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 376-376, 2015.
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WS12-5 Genetic mechanism underlying the parallel evolution of lip thickness in east African cichlids
NIKAIDO, Masato1, OKADA, Norihiro2
1Dept. Biol. Sci.s, Guraduate Sch. Biosci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech., 2Foundation for Advancement of InterNatl. Sci.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 377-377, 2015.
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WS12-6 Whole-genome Japanese Reference Panel and future directions
NAGASAKI, Masao1,2,3, YASUDA, Jun1,2, KATSUOKA, Fumiki1,2, NARIAI, Naoki1, KOJIMA, Kaname1,2, KAWAI, Yosuke1,2, YAMAGUCHI-KABATA, Yumi1,2, YOKOZAWA, Junji1,2, DANJOH, Inaho1,2, SAITO, Sakae1,2, SATO, Yukuto1,2, MIMORI, Takahiro1, TSUDA, Kaoru1, SAITO, Rumiko1, PAN, Xiaoqing1, NISHIKAWA, Satoshi1, ITO, Shin1, KUROKI, Yoko1, TANABE, Osamu1,2, FUSE, Nobuo1,2, KURIYAMA, Shinichi1,2,4, KIYOMOTO, Hideyasu1,2, HOZAWA, Atsushi1,2, MINEGISHI, Naoko1,2, KINOSHITA, Kengo1,2,3, KURE, Shigeo1,2, YAEGASHI, Nobuo1,2, ToMMo Japanese Reference Panel Project1, YAMAMOTO, Masayuki1,2
1Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku Univ., 2Grad. Sch. Med., Tohoku Univ., 3Grad. Sch. Inform. Sci., Tohoku Univ., 4InterNatl. Res. Inst. of Disaster Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 377-377, 2015.
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ISYR-1 Molecular analysis of the site-specific recombination mediated by XerA from Thermoplasma acidophilum
JO, Minji1, TSUTSUI, Yasuhiro1,2, IWASAKI, Hiroshi1
1Lab. Chrom. Dynamics, Biological Inform. and Biogenesis, Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech., 2Roche Diagnostics
Genes & Genetic Systems 90 (6) 377-377, 2015.
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ISYR-2 Fission yeast CENP-T nucleosomes promote the isochromosome formation in centromere
SU, Jie1, OKITA, Akiko1, TAKAHASHI, Tatsuro1, MASUKATA, Hisao1, NAKAGAWA, Takuro1
1Dept. Biol. Sci.s, Grad. Sch. Sci., Osaka Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 377-377, 2015.
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ISYR-3 Genome-wide identification and classification of G protein-coupled receptors in fish genomes based on conserved domain signatures
LIN, Jinn-Jy1,2,3, WANG, Feng-Yu4, WANG, Tzi-Yuan1, LI, Wen-Hsiung1,3
1Biodiversity Res. Center, Academia Sinica, 2Bioinform. Program, Taiwan InterNatl. Graduate Program, Inst. Inform. Sci., Academia Sinica, 3Inst. Molec. Cell. Biol., Natl. Tsing Hua Univ., 4Taiwan Ocean Res. Inst., Natl. Applied Res. Laboratories, Kaohsiung
Genes & Genetic Systems 90 (6) 378-378, 2015.
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ISYR-4 Brain gene expression profiling in the fire ant, Solenopsis invicta : division of labor and colony form
VIET-DAI, Dang1,2,3, CHANG, Ni-Chen (Sylvia)1, WANG, John1
1Biodiversity Res. Center, Academia Sinica, 2TIGP-Biodiversity Program, Academia Sinica, 3Life Sci. Department, Natl. Taiwan Normal Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 378-378, 2015.
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ISYR-5 Study on the origin of fibromelanosis using genetic comparison between Indonesian Cemani chicken and other domesticated chickens
DHARMAYANTHI, Anik Budhi1, TERAI, Yohey1, SATTA, Yoko1
1Dept. Evolutionary Studies of Biosyst., Sch. Adv. Sci., SOKENDAI
Genes & Genetic Systems 90 (6) 378-378, 2015.
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ISYR-6 Accumulation of genetic incompatibilities across cycles of isolation and migration
YANG, Ming1
1State Key Lab. Biocontrol, Grad. Sch. Life Sci.s, Sun Yat-Sen Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 378-378, 2015.
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1A-01 Inference of negative selection on human genome from whole genome sequences of 1070 individuals
KAWAI, Yosuke1, NARIAI, Naoki1, KOJIMA, Kaname1, YAMAGUCHI-KABATA, Yumi1, SATO, Yukuto1, MIMORI, Takahiro1, NAGASAKI, Masao1
1Dept. Inst. Genomics, Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 379-379, 2015.
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1A-02 Estimation of allele frequency of pathological variants based on whole-genome sequencing of 1070 Japanese individuals
YAMAGUCHI-KABATA, Yumi1,2, KAWAI, Yosuke1,2, KOJIMA, Kaname1,2, NARIAI, Naoki1,2, MIMORI, Takahiro1, SATO, Yukuto1,2, KATSUOKA, Fumiki1,2, YASUDA, Jun1,2, YAMAMOTO, Masayuki1,2, NAGASAKI, Masao1,2,3
1Dept. Inst. Genomics, Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku Univ., 2Grad. Sch. Med., Tohoku Univ., 3Grad. Sch. Inform. Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 379-379, 2015.
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1A-03 Spread of reduced activity of STX promoter throughout Great Journey
FUJITO, Naoko1, SATTA, Yoko1, HANE, Masaya2, MATSUI, Atsushi3, KITAJIMA, Ken2, SATO, Chihiro2, HAYAKAWA, Toshiyuki4
1Sch. Adv. Sci., SOKENDAI (The Grad. Univ. Adv. Stud.), 2Biosci. and BioTech. Center, Nagoya Univ., 3Primate Res. Inst., Kyoto Univ., 4The Grad. Sch. Systems Life Sci.s, Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 379-379, 2015.
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1A-04 Transcriptome analysis of early embryos of interspecific avian hybrids
ISHISHITA, Satoshi1, TATSUMOTO, Shoji2, KINOSHITA, Keiji1, ASANO, Yumi3, TADA, Masako3, GO, Yasuhiro2, MATSUDA, Yoichi1
1Avian Biosci. Res. Cent., Grad. Sch. Bioagricultural Sci., Nagoya Univ., 2Dept. Brain Sci.s, Center for Novel Sci. Initiatives, Natl. Inst. Natural Sci., 3Div. Chromosome Engineering & Therapeutics, Chromosome Eng. Res. Cent., Tottori Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 379-379, 2015.
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1A-05 Hybrid sterility and functional diversification of a chromatin-binding protein in threespine sticklebacks
YOSHIDA, Kohta1, ISHIKAWA, Asano1, MAKINO, Takashi2, KITANO, Jun1
1Div. Ecological Genetics, Dept. Popul. Genet., Natl. Inst. Genet., 2Dept. Ecology and Evolutionary Biol., Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 380-380, 2015.
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1A-06 Weak selection on codon usage biases estimation of positive selection by the McDonald-Kreitman approach
MATSUMOTO, Tomotaka1, CENTURION, Pablo2, LI, Boyang3, AKASHI, Hiroshi1
1Div. Evolutionary Genet., Natl. Inst. Genet., 2Dept. Biochem., Univ. Oxford, 3Sch. Management Sci. Eng., Dongbei Univ. Finance and Economics
Genes & Genetic Systems 90 (6) 380-380, 2015.
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1B-01 Molecular mechanism of restorer-of-fertility gene Rf1 diversification in sugar beet
UE, Sachiyo1, YOSHIDA, Yu1, KAMEI, Yoko1, KUBO, Tomohiko1
1Grad. Sch. Agr., Hokkaido Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 380-380, 2015.
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1B-02 Analysis of genetic diversity of black woodpecker based on mitochondrial DNA
KURO-O, Masaki1,3, SOGO, Naoki1, FUJII, Tadashi2, NAGAI, Kazuya1, HAMA, Kanae3, YAGIHASHI, Hayato1
1Grad. Sch. Agri. Life Sci., Hirosaki Univ., 2Iwate Pref. Museum, 3Dept. Biol., Faclt. Agr. Life Sci., Hirosaki Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 380-380, 2015.
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1B-03 The utility of genetic difference considering insertion and deletion
NISHIMAKI, Takuma1, SATO, Keiko1
1Tokyo Univ. Sci.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 381-381, 2015.
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1B-04 Biased phylogenetic tree estimation by evolutionary pattern changes and its correction by data-filtering (2)
IWAMOTO, Eisuke1, TAMURA, Koichiro1,2
1Dept. Biol. Sci.s, Tokyo Metro. Univ., 2Res. Center for Genomics and Bioinform., Tokyo Metropolitan Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 381-381, 2015.
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1C-01 Analysis of non-coding region proximal to the alpha operon in Bacillus usbtilis
SHIRAKAWA, Fuminori1, IKEDA, Soutaro1, ASAI, Kei1
1Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 381-381, 2015.
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1C-02 Analysis of mechanism of stress response induced with the plant essential oils in Bacillus subtilis
OZAWA, Yoshiki1, OANA, Ayumi1, SHINJOU, Yu1, HASEGAWA, Toshio1, ASAI, Kei1
1Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 381-381, 2015.
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1C-03 Phenotypic research of Bacillus subtilis strain possessing only minimum number of sigma factors
YOSHIDA, Saki1, UEKI, Noriko1, ASAI, Kei1
1The Grad. Sch. Sci. Eng., Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 382-382, 2015.
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1C-04 The role of SigI at stationary phase in Bacillus subtilis
SHIMIZU, Yoko1, ASAI, Kai1
1The Grad. Sch. Sci. Eng., Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 382-382, 2015.
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1C-05 Reconstitution of cyanobacterial RNA polymerase in Bacillus subtilis cell
KEI, Asai1, TAKAHASHI, Hiroki1, WATANABE, Satoru2, YOSHIKAWA, Hirofumi2
1Saitama Univ., Grad. Sch. Sci. and Tech., 2Tokyo Univ. Agr., Faclt. applied bioSci.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 382-382, 2015.
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1C-06 Analysis of transcriptional regulation of sigI in Bacillus subtilis
MATSUOKA, Satoshi1, MATSUMOTO, Kouji1, HARA, Hiroshi1
1Grad. Sch. Sci. Eng., Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 382-382, 2015.
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2A-01 Difference in dominated mitochondrial CO1 haplotypes was observed in Bombyx mandarina populations from Hokuriku to Kyushu and its surrounding islands
YUKUHIRO, Kenji1, KOMOTO, Natuo1, TOMOTA, Shuichiro1, SAKAGUCHI, Hiroki2, ITOH, Masanobu2, NAKAJIMA, Yumiko3
1Genetically Modified Organism Res. Center, Natl. Inst. AgroBiol. Sci., 2Dept. Appl. Biol., Kyoto Inst. Tech., 3Central Inst. Radioisotope Sci.s and Safety, Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 383-383, 2015.
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2A-02 Molecular phylogenetic study of the subgenus Sophophora (Diptera : Drosophilidae) and its related taxa based on 50 nuclear gene loci
KATOH, Takehiro K1, WATADA, Masayoshi1
1Grad. Sch. of Sci. and Engr., Ehime Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 383-383, 2015.
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2A-03 Genetic diversity of neo-Y chromosome in Drosophila albomicans
SATOMURA, Kazuhiro1, TAMURA, Koichiro1,2
1Dept. Biol. Sci.s, Tokyo Metro. Univ., 2Res. Center for Genetics and Bioinform., Tokyo Metropolitan Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 383-383, 2015.
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2A-04 Sequence diversity of Drosomycin genes within Drosophila lutescens
ICHIKAWA, Risa1, SETO, Yosuke1, TAMURA, Koichiro1
1Dept. Biol. Sci.s, Tokyo Metro. Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 383-383, 2015.
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2A-05 Feminization and masculinization have accelerated pseudogenization on neo-sex chromosomes in Drosophila miranda
NOZAWA, Masafumi1
1Lab. DNA Data Analysis, Center for Inform. Biol., Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 384-384, 2015.
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2A-06 Using Pooled RNA-seq, detecting adaptive evolution for cold temperature of D.albomicans
NAKAMURA, Yo1, TAMURA, Koichiro1
1Tokyo Metropolitan Univ., Dept. Biol. Sci., Evolution genetics Lab.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 384-384, 2015.
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2A-07 Comparative analysis of anti-fungal immune system of Drosophila
SETO, Yosuke1, TAMURA, Koichiro1,2
1Dept. Biol. Sci.s, Sch. Sci. Eng., Tokyo Metropolitan Univ., 2Res. Center for Genomics and Bioinform., Tokyo Metropolitan Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 384-384, 2015.
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2A-08 A search for polymorphisms associated with facial morphology in Japanese
KIMURA, Ryosuke1, WATANABE, Chiaki1, MIYAZATO, Eri1, ITO, Tsuyoshi1, YAMAGUCHI, Kyoko1, SATO, Takehiro1, KAWAGUCHI, Akira1, ISHIDA, Hajime1, YAMAGUCHI, Tetsutaro2, YAMAMOTO, Ken3
1Grad. Sch. of Med., Univ. of the Ryukyus, 2Sch. Dentistry, Showa Univ., 3Kurume Univ. Sch. of Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 384-384, 2015.
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2A-09 Genome history of people on Japanese Archipelago
SAITOU, Naruya1, TIMOTHY A.Jinam
1Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 385-385, 2015.
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2A-10 Biological processes enriched in gene with long poly-Q may be commonly involved in pathogenesis of poly-Q diseases
SHIMADA, Makoto K.1,2,3, SANBONMATSU, Ryoko3, YAMAGUCHI-KABATA, Yumi2,3,4, YAMASAKI, Chisato2,3, SUZUKI, Yoshiyuki5, CHAKRABORTY, Ranajit6, GOJOBORI, Takashi2,3,7, IMANISHI, Tadashi2,3,8
1Inst. Comprehensive Med. Sci., Fujita Health Univ., 2Natl. Inst. Adv. Industrial Sci. & Tech., 3Japan Bio. Informatics Consortium, 4Tohoku Med. Megabank Organization, Tohoku Univ., 5Grad. Sch. Natural Sci.s, Nagoya City Univ., 6Health Sci. Cent., Univ. North Texas, 7Comp. BioSci. Res. Cent., King Abdullah Univ. Sci. & Tech., 8Dept. Mol. Life Sci., Tokai Univ. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 385-385, 2015.
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2A-11 Effects of periodic changes in population size on genetic diversity
NAKAMURA, Haruna1, TESHIMA, Kosuke1, TACHIDA, Hidonori1
1Dept. Biol., Faclt. Sci.s, Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 385-385, 2015.
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2A-12 Patterns of Measures of Divergence Between Populations
KAWAMURA, Sayu1, TESHIMA, Kosuke M.1
1Dept. Biol., Faclt. Sci.s, Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 385-385, 2015.
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2A-13 Experimental evolutionary study based on big data of mouse germline mutations from ENU mutagenesis
OOTA, Satoshi1, FUKUMURA, Ryutaro2, GONDO, Yoichi2
1RIKEN BioRes. Cent. Bioresource Inform. Division, 2RIKEN BioRes. Cent. Mutagenesis and Genomics Team
Genes & Genetic Systems 90 (6) 386-386, 2015.
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2A-14 Strain difference of tameness in wild-derived strains and genetic analysis using heterogeneous stock
KOIDE, Tsuyoshi1,2,3, GOTO, Tatsuhiko4, MATSUMOTO, Yuki1,2
1Mouse Genomics Resource Lab., Natl. Inst. Genet., 2Dept. Genet., SOKENDAI, 3Transdisciplinary Res. Integration Cent., ROIS, 4College of Agriculture, Ibaraki Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 386-386, 2015.
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2A-15 Identification of genetic loci associated with tame behavior using selective breeding and genome-wide analysis in mice
MATSUMOTO, Yuki1,2, NAKAOKA, Hirofumi3, NISHINO, Jo4, GOTO, Tatsuhiko5, KOIDE, Tsuyoshi1,2
1Dept. Genet., SOKENDAI, 2Mouse Genomics Resource Lab., Natl. Inst. Genet., 3JSPS Res. Fellow, 4Div. Human Genet., Natl. Inst. Genet., 5Grad. Sch. Med., Nagoya Univ., 6College of Agriculture, Ibaraki Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 386-386, 2015.
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2A-16 Attempts at generating mutants in a non-model species, Drosophila subobscura, by means of the CRISPR-Cas9 system
MURAKAMI, Hinata1, TANAKA, Ryoya2, ITO, Hiroki2, YAMAMOTO, Daisuke2
1Div. Neurogenetics, Dept. Dev. Biol., Faclt. Sci., Tohoku Univ., 2Div. Neurogenetics, Dept. Dev. Biol. NeuroSci. Grad. Sch. Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 386-386, 2015.
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2B-01 Tetrasomic recombination in allotetraploid Arachis
SHIRASAWA, Kenta1, LEAL-BERTIOLI, Soraya2,3, ABERNATHY, Brian3, MORETZSOHN, Marcio2, CHAVARRO, Carolina3, CLEVENGER, Josh4, OZIAS-AKINS, Peggy4, JACKSON, Scott3, BERTIOLI, David3,5
1Lab Plant Genomics Genet, Dept Frontier Res, Kazusa DNA Res Inst, 2Embrapa Genet. Resources and BioTech., 3Center for Applied Genetic Technologies, Univ. Georgia, 4Dept. Horticulture, Univ. Georgia, 5Univ. Brasilia, Inst. Biol. Sci.s
Genes & Genetic Systems 90 (6) 387-387, 2015.
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2B-02 The MRX complex ensures NHEJ fidelity through multiple pathways including Xrs2-FHA-dependent Tel1 activation
SHINOHARA, Miki1,2, IWASAKI, Daichi1,2
1Lab. Genome-Chromosome functions, Inst. Prot. Res., Osaka Univ., 2Dept. Biol. Sci.s, Grad. Sch. Sci., Osaka Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 387-387, 2015.
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2B-03 Speed of DNA replication fork was reduced in Escherichia coli cells overexpressing either recA or dinB gene
TAN, Kang Wei1, PHAM, Tuan Minh1, FURUKOHRI, Asako1, MAKI, Hisaji1, AKIYAMA, Masahiro T.1
1Lab. Microbial Molec. Genet., Grad. Sch. Biol. Sci.s, Nara Inst. Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 387-387, 2015.
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2B-04 Effects of proofreading-deficient DNA polymerase I on spontaneous mutagenesis in Escherichia coli
YAMAMOTO, Takashi1, MAKI, Hisaji1
1Dept. of Mol. Biol., Grad. Sch. Biol. Sci., Nara Inst. Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 387-387, 2015.
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2B-05 Effects of the PCNA-DNA interactions on the DNA polymerase / exonuclease reactions by archaeal replicative DNA polymerase
NISHIDA, Hirokazu1,3, YODA, Takuya2, TANABE, Maiko3, SHIRAI, Tsuyoshi4, TAKEYAMA, Haruko2, ISHINO, Yoshizumi5
1New Energy and Industrial Tech. Dev. Organization, 2Dept. Life Sci. and Medical Biosci., Waseda Univ., 3Res. & Dev. Group, Hitachi, Ltd., 4Dept. Computer Biosci., Nagahama Inst. BioSci. and Tech., 5Dept. BioSci. and BioTech., Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 388-388, 2015.
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2B-06 A genetic screen for genes that suppress the temperature sensitivity of mgs1-18 rad18Δ cells in Saccharomyces cerevisiae
ISIHGE, Daisuke1, KEYAMURA, Kenji2, HASEGAWA, Yuki2, IWASAKI, Hiroshi1, HISHIDA, Takashi2
1Dept. Life Sci., Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech., 2Graduate Course in Life Sci., Grad. Sch. Sci., Gakushuin Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 388-388, 2015.
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2B-07 Genetic interactions of Rad51 with Swi5-Sfr1 and with Rad55-Rad57 protein complexes in Schizosaccharomyces pombe
IWASAKI, Hiroshi1, ITO, Kentaro1, TSUTSUI, Yasuhiro1,2, KUROKAWA, Yumiko1, MURAYAMA, Yasuto1, TAKAHASHI, Masayuki1
1Tokyo Inst. Tech., 2Roche Diagnostics K.K.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 388-388, 2015.
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2B-08 High-level expression of limiting factors for the initiation of DNA replication counteracts chromatin silencing
ONAMI, Mayumi1, ARAKI, Hiroyuki1,2, TANAKA, Seiji1,2
1Div. Microbial Genet., Natl. Inst. Genet., 2SOKENDAI
Genes & Genetic Systems 90 (6) 388-388, 2015.
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2B-09 Roles of Drosophila orthologs of human male-infertility genes in spermatogenesis
NAKATSUKA, Mihoko1, WATANABE, Masahide2, TOMARU, Masatoshi2, TAKANO-SHIMIZU, Toshiyuki2
1Appl. Biol., Grad. Sch. Sci. Tech., Kyoto Inst. Tech., 2Dept. Drosophila Genomics and Genetic Resources, Kyoto Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 389-389, 2015.
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2B-10 Elongation of synaptonemal complex in meiosis regulates crossover numbers between homologs dependent on chromosome-size
HIGASHIDE, Mika1,2, SHINOHARA, Miki1,2
1Lab. of Genome and Chromosome functions, Dept. of Bio. Sci., Grad. sch. of Sci., Osaka Univ., 2Inst. Prot. Res., Osaka Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 389-389, 2015.
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2B-11 Roles for DnaA protomers on the replication origin in duplex unwinding
SAKIYAMA, Yukari1, NOGUCHI, Yasunori1, KAWAKAMI, Hironori1, KATAYAMA, Tsutomu1
1Dept. Mol. Biol., Grad. Sch. Pharm Sci., Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 389-389, 2015.
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2B-12 Purification and functional analysis of the pyrophosphatase Thermus thermophilus Ham1
NISHIMURA, Miki1, MORIMOTO, Emiko2, HIRATSU, Keiichirou3, MERA, Hanaka2, NUNOSHIBA, Tatsuo1,2
1InterNatl. Christian Univ. Grad. Sch. Arts and Sci., 2InterNatl. Christian Univ., 3Natl. Defense Acad.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 389-389, 2015.
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2C-01 X chromosome inactivation in the mouse embryos deficient for SmcHD1
SAKAKIBARA, Yuki1, SASAKI, Hiroyuki1, BLEWITT, Marnie2, SADO, Takashi3
1Div. Epigenomics and Dev., Med. Inst. Bioreg., Kyushu Univ., 2The Walter and Eliza Hall Inst. Med. Res., 3Dept. Adv. Biosci., Faclt. Agr., Kinki Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 390-390, 2015.
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2C-02 The role of DNA methylation in Epigenetic barrier between Naive and Primed state
URA, Hiroki1, NIWA, Hitoshi2, ABE, Kuniya1
1Tech. and Dev. Team for Mammalian Genome Dynamics, RIKEN BioRes. Cent., 2Lab. Pluripotent Cell Studies, RIKEN Center for Dev. Biol.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 390-390, 2015.
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2C-03 The defects in X-inactivation by partially dysfunctional Xist allele
NAKAJIMA, Tatsuro1,2, HOKI, Yuko1, SASAKI, Hiroyuki1, SADO, Takashi1,3
1Div. Epigenomics and Dev., Med. Inst. Bioregulation, Kyushu Univ., 2Grad. Sch. of Med. Sci., Kyushu Univ., 3Dept. Adv. Biosci., Grad. Sch. Agr., Kinki Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 390-390, 2015.
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2C-04 Differential expression of Xist in the mouse preimplantation embryo
SADO, Takashi1,2, SAKATA, Yuka1,2, AMAKAWA, Yuko3, HOKI, Yuko2, FUKAGAWA, Tatsuo3, SASAKI, Hiroyuki2
1Grad. Sch. Agri., Kinki Univ., 2Med. Inst. Bioreg., Kyushu Univ., 3Natl, Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 390-390, 2015.
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2C-05 The prediction of the effect of CpG around transcription start site on sex-biased gene expresion
TAMAGAWA, Katsunori1
1Div. Ecology and Evolutionary Biol. Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 391-391, 2015.
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2C-06 DNA methylation of the germ cells in Japanese hagfish, Eptatretus burger
GOTO, Yuji1, OHSAWA, Daiki1, KUBOTA, Souichirou1
1Dept. Biol., Faclt. Sci., Toho Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 391-391, 2015.
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2C-07 Diversity of P element piRNAs production and mRNA expression in natural populations of Drosophila melanogaster
WAKISAKA, Keiko1, ITOH, Masanobu1
1Kyoto Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 391-391, 2015.
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2C-08 HDAC regulates a novel mechanism for plant drought tolerance
KIM, Jong-Myong1,2, TO, Taiko Kim3, SEKI, Motoaki1,2,4
1RIKEN Center for Sustainable Resource Sci., Plant Genomic Network Res. Team, 2CREST JST, 3Natl. Inst. Genet., Dept. Integrated Genetics, 4Yokohama City Univ., Kihara Biol. Inst.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 391-391, 2015.
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2C-09 The analysis of suppression mechanism in AtRE1, a copia-type retrotransposon found in Arabidopsis thaliana
JIN, Jing1, YAMAGISHI, Yumi1, ITO, Hidetaka2, KATO, Atsushi2
1Grad. Sch. Life Sci., Hokkaido Univ., 2Dept. Biol. Sci., Faclt. Sci., Hokkaido Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 392-392, 2015.
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2C-10 Searching candidate imprinted genes in Brassica rapa
BO, Yina1, YOSHIDA, Takanori1, KAWABE, Akira1
1Div. Life Sci.s, Grad. Sch., Kyoto Sangyo Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 392-392, 2015.
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2C-11 Analysis of epigenetic gene expression change of DNA damage induction
OKI, Masaya1,2, OGINO, Yuhei1, UCHIDA, Hiroyuki1
1Dept. Appl. Chem. & BioTech., Grad. Sch. Eng., Univ. Fukui, 2Res. and Education Program for Life Sci., Univ. of Fukui
Genes & Genetic Systems 90 (6) 392-392, 2015.
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2C-12 Sensitivity of Escherichia coli lactose repressor to the inducer molecule
KONDO, Keiichiro2, ONO, Katsuhiko1, KINJO, Mikiko2, ABO, Tatsuhiko1
1Grad. Sch. Natural Sci. Tech., Okayama Univ., 2Dept. Biol., Faclt. Sci., Okayama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 392-392, 2015.
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2C-13 Analysis of the activation mechanism of an extracytoplasmic function σ factor σV in the Bacillus subtilis cells lacking glucolipids
SEKI, T.1, MINESHIMA, R.1, MATSUOKA, S.1, MATSUMOTO, K.1, HARA, H.1
1Dept. Biochem. and Molecular Biol., Graduate School of Sci. and Engineering, Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 393-393, 2015.
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2C-14 Targeting preference and expression profile of human microRNAs
IWAMA, Hisakazu1, FUJITA, Koji2, IMACHI, Hitomi3, MURAO, Koji3, MASAKI, Tsutomu2
1Life Sci. Res. Cent., Kagawa Univ., 2Dept. Gastroenterology and Neurology, Faclt. Med., Kagawa Univ., 3Dept. Endocrinology and Metabolism, Faclt. Med., Kagawa Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 393-393, 2015.
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3A-01 Evolution and diversity of receptor as the sensor of the environment and essential protein for survive
IWASAKI, Risa1, GOJOBORI, Jun1, SATTA, Yoko1
1Sokendai (The Grad. Univ. Adv. Stud.), Sch. Adv. Sci., Dept. Evolutionary Studies of Biosyst.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 393-393, 2015.
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3A-02 Time-dependent directional change in oligonucleotide composition found by big data analyses on zoonotic RNA viruses
IKEMURA, Toshimichi1, WADA, Yoshiko1,2, IWASAKI, Yuki1,3, WADA, Kennosuke1, KANAYA, Shigehiko2
1Nagahama Inst. Bio-Sci. Tech., 2Nara Inst. Sci. Tech., 3Natl. Res. Inst. of Fisheries Sci.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 393-393, 2015.
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3A-03 Molecular evolutionary characteristics of mitogenome in Ctenophora
SAITO, Takahiko2, HANZAWA, Naoto1, GOTOH, Ryo3, MOCHIZUKI, Shota2, OKUIZUMI, Kazuya4, SEKIZAWA, Miku5, MIYAKE, Hiroshi6
1Dept. Biol., Faclt. Sci., Yamagata Univ., 2Grad. Sch. Sci. Eng., Yamagata Univ., 3Natural History Museum and Inst., Chiba, 4Tsuruoka City Kamo Aquarium, 5Grad. Sch. of Marine Biosci.s, Kitasato Univ., 6Sch. Marine Biosci.s, Kitasato Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 394-394, 2015.
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3A-04 Phylogenetic position of ctenophores and early evolution of metazoans
TAKAHASHI, Keisuke1, KATOH, Kazutaka2, IWABE, Naoyuki3
1Dept. Biophys., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ., 2IFReC, Osaka Univ., 3Dept. Biophys., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 394-394, 2015.
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3A-05 Evolution of TRP gene copy number in Echinoderms
GOJOBORI, Jun1, HAMANAKA, Gen2, KAWAI, Narudo3, FURUKAWA, Ryohei4, KANEKO, Hiroyuki3, SAITO, Shigeru5, TOMINAGA, Makoto5, SATTA, Yoko1
1Sch. Adv. Sci., The Grad. Univ. Adv. Stud., 2Marine and Coastal Res. Center, Ochanomizu Univ., 3Res. and Education Center for Natural Sci.s, Keio Univ., 4Iwate Med. Univ., 5Okazaki Inst. Integ. Biosci. (Natl. Inst. Physiological Sci.)
Genes & Genetic Systems 90 (6) 394-394, 2015.
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3A-06 Characterization of inverted repeats in the mitochondrial genome of Medusozoan jellyfish
GOTOH, Ryo O.1,2, FUNAHASHI, Anna3, HANZAWA, Naoto2
1Natural History Museum and Inst., 2Dept. Biol., Faclt. Sci., Yamagata Univ., 3Grad. Sch. Sci. Eng., Yamagata Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 394-394, 2015.
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3A-07 Phylogenetic relationship of coelacanths, lungfishes, and tetrapods
TAKEZAKI, Naoko1, NISHIHARA, Hidenori2
1Life Sci. Res. Cent., Kagawa Univ., 2Tokyo Inst. Tech. Grad. Sch. BioSci. and BioTech. Dept. Biol. Sci.s
Genes & Genetic Systems 90 (6) 395-395, 2015.
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3A-08 Molecular Evolution of ATP Synthase in Notothenioid Fish
NAGATA, Ken1, OTA, Tatsuya1
1Dept. Evolutionary Studies of Biosyst., SOKENDAI (The Grad. Univ. Adv. Stud.)
Genes & Genetic Systems 90 (6) 395-395, 2015.
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3A-09 Analysis of population structure of Cryptomeria japonica based on amplicon sequenced data
MORIGUCHI, Natsuki1, UCHIYAMA, Kentaro2, MIYAGI, Ryutaro3, TAKAHASHI, Aya3, TAMURA, Koichiro3, TSUMURA, Yoshihiko4, TESHIMA, Kosuke6, KUSUMI, Junko5, TACHIDA, Hidenori6
1Lab. Evolutionary Genetics, Grad. Sch. of System Life Sci., Kyushu Univ., 2Dept. Forest Genetics, Forestry Forest Products Res. Inst., 3Evolutional Genetic Lab., Dept. Biol. Sci.s, Tokyo Metro. Univ., 4Faclt. Life and Env. Sci.s, Univ. Tsukuba, 5Dept. Env. Changes Faclt. Social and Cultural Studies, Kyushu Univ., 6Dept. Biol., Faclt. Sci.s, Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 395-395, 2015.
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3A-10 An introgressive hybrid between wild Vigna species found in a limestone rock mountain
NAITO, Ken1, TAKAHASHI, Yu1, ISEKI, Kohtaro1, KITAZAWA, Kumiko2, IRIE, Kenji2, TOMOOKA, Norihiko1
1Genetic Resource Center, Natl. Inst. AgroBiol. Sci., 2Dept. InterNatl. Agricultural Dev., Tokyo Univ. Aguricuture
Genes & Genetic Systems 90 (6) 395-395, 2015.
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3A-11 Divergence of RNA editing in chloroplast genome among Arabidopsis species
KAWABE, Akira1, FURIHATA, Hazuka Y.1, YOSHIDA, Takanori1
1Kyoto Sangyo Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 396-396, 2015.
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3A-12 Characterisation of major histocompatibility complex class II (MHCII) in Japanese frogs
LAU, Quintin1, IGAWA, Takeshi2, SATTA, Yoko1
1Sokendai (The Grad. Univ. Adv. Stud.), 2Hiroshima Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 396-396, 2015.
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3B-01 Molecular mechanism of SOG1 activation in response to DNA damage
YOSHIYAMA (OKAMOTO), Kaoru1, KIMURA, Seisuke1
1Life Sci.s, Kyoto Sangyo Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 396-396, 2015.
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3B-02 Effects of nutrient on cellular ROS level and oxidative DNA damage in Escherichia coli
NUNOSE, Shohei1, CONRAD, Tom1, ANDO, Sayaka1, TOYOMOTO, Minae1, NAKAMURA, Aoi1, AKIYAMA, Masahiro1, MAKI, Hisaji1
1Lab. Microbial Molec. Genet., Grad. Sch. of Biological Sci., Nara Inst. Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 396-396, 2015.
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3B-03 Identification of novel oxidative stress response gene in Saccharomyces cerevisiae
YAMASAKI, Akira1, SANADA, Yu1, ZHANG-AKIYAMA, Qiu-Mei1
1Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 397-397, 2015.
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3B-04 Studies on the de-ubiquitination mechanism for the xeroderma pigmentosum group C protein in UV damage response
SAKAI, Wataru1,2, KISHIMOTO, Aiko1,2, MATSUI, Takeshi1,2, AKAGI, Jun-ichi1, SUGASAWA, Kaoru1,2
1Biosignal Res. Cent., Kobe Univ., 2Dept. Biol., Grad. Sch. Sci., Kobe Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 397-397, 2015.
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3B-05 Oxidative DNA damage level is elevated in low pH medium in Escherichia coli
MIYAHARA, Ryota1, MAKI, Hisaji1
1Lab. Microbial Molec. Genet., Grad. Sch. of Biological Sci., NAIST
Genes & Genetic Systems 90 (6) 397-397, 2015.
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3B-06 The effects of AP sites repair enzymes on Ciona intestinalis embryogenesis
FUNAKOSHI, Masafumi1, IGARASHI, Kento1, ZHANG-AKIYAMA, Qiu-Mei1
1Stress Response Biol., Div. Biol. Sci., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 397-397, 2015.
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3B-07 The Analysis of Functional Relationship between Oxidation Resistance 1 (OXR1) Gene and Oxidative Defense Genes in C. elegans
MIYAJI, Masahiro1, ZHANG-AKIYAMA, Qiu-Mei1
1Lab. Stress Response Biol., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 398-398, 2015.
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3B-08 The role of mismatch repair system in the integrity of germline genome
OHNO, Mizuki1, TAKANO, Noriko1, SASAKI, Fumiko1, NAKATSU, Yoshimichi1, TSUZUKI, Teruhisa1
1Dept. Med. Biophysics and Radiation Biol., Faclt. Medical Sci., Kyushu Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 398-398, 2015.
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3B-09 Long-term effects of chronic low-dose UV irradiation in nucleotide excision repair-deficient cell
SHIOIRI, Takuma1, KEYAMURA, Kenji1, HISHIDA, Takashi1
1Dept. Molec. Genet., Grad. Sch. Life Sci., Gakushuin Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 398-398, 2015.
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3B-10 The role in BER of DIMT1L and TFB1M, human homologs of KsgA, DNA glycosylase of E.coli
HAYASHI, Yuichiro1, MIYAJI, Masahiro1, ZHANG-AKIYAMA, Qiu-Mei1
1Lab. Stress Response Biol., Grad. Sch. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 398-398, 2015.
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3B-11 Mathematical model which can estimate the mutation frequency induced by radiation, considering dose rate explicitly
MANABE, Yuichiro1, WADA, Takahiro2, TSUNOYAMA, Yuichi3, NAKAJIMA, Hiroo4, BANDO, Masako5,6
1Quantum and Energy Engineering, Div. Sustainable Energy and Env. Engineering, Grad. Sch. Eng., Osaka Univ., 2Faclt. Eng. Sci., Kansai Univ., 3Div. Biol., Radioisotope Res. Center, Kyoto Univ., 4Dept. Radiation Biol. and Medical Genetics, Grad. Sch. Med., Osaka Univ., 5Yukawa Inst. Theoretical Physics, Kyoto Univ., 6Res. Center for Nuclear Physics, Osaka Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 399-399, 2015.
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3C-01 Interaction between RcsF and RcsC in the periplasmic space of Escherichia coli
SATO, Takatsugu1, TAKANO, Akira1, MATSUMOTO, Koji1, MATSUOKA, Satoshi1, HARA, Hiroshi1
1Dept. Biochem. Mol. Biol., Programs in Life Sci., Grad. Sch. Sci. Eng., and Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 399-399, 2015.
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3C-02 Analysis of E.coli RcsF, a component of the Rcs signal transduction system
IZAWA, Tomoko1, TAKANO, Akira1, MATSUMOTO, Kouji1, MATSUOKA, Satoshi1, HARA, Hiroshi1
1Dept. Biochem. Mol. Biol., Program in Life Sci., Guraduate Sch. Sci. Eng., Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 399-399, 2015.
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3C-03 Analyses of spatiotemporal regulatory mechanisms of mesendoderm segregation in zebrafish
HOZUMI, Shunya1, AOKI, Shun1, KIKUCHI, Yutaka1
1Dept. Biol. Sci., Grad. Sch. Sci., Hiroshima Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 400-400, 2015.
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3C-04 Analysis of circadian clock gene expressions in the petal movement mutants
KUTSUNA, Shinsuke1, SEGAWA, Yuki1, KOIKE, Anna1, ONAI, Kiyoshi2, ISHIURA, Masahiro2
1Grad. Sch. of Bionanosystem Sci., Yokohama City Univ., 2Cent. Gene Res., Nagoya Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 400-400, 2015.
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3C-05 Identification of genes related to the light-induced degradation of Chlamydomonas clock protein ROC15
KINOSHITA, Ayumi1, MATSUO, Takuya1,2, NIWA, Yoshimi1, YAMANO, Takashi3, FUKUZAWA, Hideya3, ISHIURA, Masahiro1
1Cent. Gene Res., Nagoya Univ., 2Grad. Sch. Sci., Nagoya Univ., 3Grad. Sch. BioStud., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 400-400, 2015.
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3C-06 An attempt to replace major membrane lipids by monoglucosyldiacylglycerol in Escherichia coli
UENO, Michimune1, MATSUMOTO, Kouji1, MATSUOKA, Satoshi1, HARA, Hiroshi1
1Dept. Biochem. Mol. Biol., Programs in Life Sci., Grad. Sch. Sci. Eng., Saitama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 400-400, 2015.
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3C-07 Rodent phenotypic diversity : insights from conserved noncoding evolution
BABARINDE, Isaac Adeyemi1,2, SAITOU, Naruya1,2,3
1Dept. Genet., The Grad. Univ. Adv. Stud. (SOKENDAI), 2Div. Popul. Genet., Natl. Inst. Genet., 3Univ. Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 401-401, 2015.
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3C-08 Novel properties of the iron-sulfur cluster biosynthesis machinery revealed by the genetic analysis of Escherichia coli mutants that can survive without the cluster
KANAZAWA, Miaki1, TANAKA, Naoyuki1, KUZUYAMA, Tomohisa2, TAKAHASHI, Yasuhiro1
1Div. of Life Sci., Grad. Sch. of Sci. and Eng., Saitama Univ., 2Biotech. Res. Ctr., Univ. of Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 401-401, 2015.
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3C-09 Functional analysis of uORF44-derived protein in mouse
KITANO, Shohei1, AIZAWA, Yasunori1,2
1Dept. Life Sci.,Tokyo Inst. Tech., 2Center for Biol. Resources and Inform., Tokyo Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 401-401, 2015.
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3C-10 Structure and evolution of the histone genes in Drosophila : H4 and H4r genes
YAMAMOTO, Yoshinori2, WATANABE, Toru2, NAKAMURA, Mayu2, KAKUBAYASHI, Norikazu2, SAITO, Yusuke2, MATSUO, Yoshinori1
1Lab. Adaptive Evolution, Inst. Socio-Arts and Sci.s, Tokushima Univ., 2Lab. Adaptive Evolution, Faclt. Integr. Arts Sci.s., Tokushima Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 401-401, 2015.
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3C-11 Adaptive significance and molecular mechanisms of intraspecific body color variation in D. melanogaster
AKIYAMA, Noriyoshi1, MIYAGI, Ryutaro1, TAKAHASHI, Aya1,2
1Dept. Biol. Sci.s, Tokyo Metro. Univ., 2Res. Center for Genomics and Bioinform., Tokyo Metropolitan Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 402-402, 2015.
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3D-01 Involvement of the perinuclear anchorage of DNA double-strand break in damage-induced sister chromatid cohesion
OMA, Yukako1, ORIHARA, Yuki1, KONISHI, Tatsunori1, HORIGOME, Chihiro2,3, GASSER, Susan M.2, HARATA, Masahiko1
1Lab. Molec. Biol., Grad. Sch. Agr. Sci., Tohoku Univ., 2FMI, Basel, 3IMCB, The Univ. Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 402-402, 2015.
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3D-02 Attempts to generate artificial ring chromosomes in rice
MURATA, Minoru1, KANATANI, Asaka1, KASHIHARA, Kazunari1, NAGAKI, Kiyotaka1
1Inst. Plant Sci. and Resources, Okayama Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 402-402, 2015.
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3D-03 Chromosome mapping by flow cytometry
ENDO, Takashi R.1
1Faclt. Agr., Ryukoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 403-403, 2015.
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3D-04 Inference of the evolutionary process of microchromosomes in vertebrates from comparative gene mapping for Polypterus
UNO, Yoshinobu1, NISHIDA, Chizuko2, TOYODA, Atsushi3, FUJIYAMA, Asao3, OKABE, Masataka4, MATSUDA, Yoichi1
1Lab. Animal Genetics, Grad. Sch. Bioagricultural Sci.s, Nagoya Univ., 2Dept. Biol. Sci.s, Faclt. Sci., Hokkaido Univ., 3Comparative Genomics Lab., Natl. Inst. Genet., 4Dept. Anatomy, The Jikei Univ. Sch. Med.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 403-403, 2015.
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3D-05 A new aspect of rRNA genes ; involvement in origin resolution by DNA condensation
NIKI, Hironori1, YANO, Koichi1
1Microbial Genetics Lab., Genetic Strains Res. Cent., Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 403-403, 2015.
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3D-06 Whole genome sequencing of Asian pit viper, Habu, Protobothrops flavoviridis and whole gene finding
SHIBATA, Hiroki1, CHIJIWA, Takahito2, ODA-UEDA, Naoko3, HATTORI, Shosaku4, KOYANAGI, Ryo5, HISADA, Kanako6, SATO, Nori6, OHNO, Motonori2, FUKUMAKI, Yasuyuki1, OGAWA, Tomohisa7
1Div. Genomics, Medical Institute of Biorgulation, Kyushu Univ., 2Faclt. BioSci. and BioTech., Sojo Univ., 3Faclt. Pharm. Sci., Sojo Univ., 4Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo, 5DNA Sequencing Section, Okinawa Inst. Sci. and Technology Univ., 6Marine Genomics Unit, Okinawa Inst. Sci. Tech. Univ., 7Grad. Sch. of Life Sci., Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 403-403, 2015.
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3D-07 Re-assessment of reference sequences of whole genome DNA
GONDO, Yoichi1
1Mutagenesis and Genomics Team, RIKEN BioRes. Cent.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 404-404, 2015.
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3D-08 Functional enrichment analysis of human transcriptional target genes and its application to their prediction
OSATO, Naoki1
1Res. Cent. Adv. Sci. Tech. (RCAST), Inst. Biol. and Mathematics of Dynamic Cellular Processes (iBMath), The Univ. Tokyo
Genes & Genetic Systems 90 (6) 404-404, 2015.
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3D-09 Systematic analysis of mutation distribution in three dimensional protein structures identifies cancer driver genes
FUJIMOTO, Akihiro1, OKADA, Yukinori2, BOROEVICH, Keith1, TSUNODA, Tatsuhiko1, TANIGUCHI, Hiroaki1, NAKAGAWA, Hidewaki1
1RIKEN Center for Integrative Medical, 2Grad. Sch. Med. and Dental Sci.s, Tokyo Medical and Dental Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 404-404, 2015.
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3D-10 A computer simulation study on the power of haplotype-based GWAS
MISAWA, K.1, KOJIMA, K.1, KAWAI, Y.1, NAGASAKI, M.1
1Dept. Inst. Genomics, Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 404-404, 2015.
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3E-01 Do melanocytes contribute to the postnatal development of the mouse blood vessels?
SHIBUYA, Hirotoshi1, TAMURA, Masaru2, WATANABE, Ryutaro1, MAENO, Akiteru3, WAKANA, Shigeharu2, SHIROISHI, Toshihiko3, YAMAMOTO, Hiroaki1
1Grad. Sch. Biosci., Nagahama Inst. Bio-Sci. Tech., 2Riken BRC, 3Mammalian Genet. Lab., Natl. Inst. Genet.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 405-405, 2015.
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3E-02 An alternative pluripotent state confers interspecies chimaeric competency
OKAMURA, Daiji1, WU, Jun2, LI, Mo2, SUZUKI, Keiichiro2, BELMONTE, Juan Carlos I.2
1Dept. Adv. Biosci., Grad. Sch. Agr., Kinki Univ., 2The Salk Inst. Biological Studies, Gene Expression Lab.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 405-405, 2015.
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3E-03 Effects of Wnt signal inhibition on establishment of EpiSCs
SUGIMOTO, Michihiko1,2, KONDO, Masayo2, KOGA, Yumiko2, IKEDA, Rieko2, CHUVA DE SOUSA LOPES, Susana M.3, ABE, Kuniya2
1Div. Dev. Genet., Inst. Resource Dev. and Analysis, Kumamoto Univ., 2Tech. and Dev. Team for Mammalian Genome Dynamics, Biores. Cent., RIKEN, 3Dept. Anatomy and Embryology, Leiden Univ. Medical Center
Genes & Genetic Systems 90 (6) 405-405, 2015.
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3E-04 Comparative proteomics database for gene spectral analysis
ENDO, Toshinori1, KOYANAGI, Ryo2, SHINZATO, Chuya2, SATOH, Nori2
1Inform. Biol. Lab., Grad. Sch. Inform. Sci. Tech., Hokkaido Univ., 2Marine Genomics Unit, Okinawa Inst. Sci. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 405-405, 2015.
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3E-05 Regulatory mechanisms of the plasticity of cell fate decision during early embryonic development
SHIOMI, Taishi1
1Dept. Biol. Sci., Grad. Sch. Sci., Hiroshima Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 406-406, 2015.
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3E-06 Genetics terminology in the highschool "biology" textbokks : current status and problems
IKEUCHI, Tatsuro1
1Formerly, Tokyo Medical and Dental Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 406-406, 2015.
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3E-07 A bioinformatics strategy to identify horizontal gene transfer on the basis of Self-Compressing BLSOM (Batch-Learning Self-Organizing Map)
MATSUMOTO, Koji1, KIKUCHI, Akihito1, IKEMURA, Toshimichi2, ABE, Takashi1
1Niigata Univ., 2Nagahama Inst. Bio-Sci. and Technol.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 406-406, 2015.
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3E-08 Function prediction of poorly characterized proteins on the basis of oligopeptide composition similarity
IKARASHI, Ryo1, IKEMURA, Toshimichi2, ABE, Takashi1
1Niigata Univ., 2Nagahama Inst. Bio-Sci. and Technol.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 406-406, 2015.
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3E-09 Spatio-temporal imaging of the Gli transcription factors : establishment of Gli3-deficient cell lines by CRISPR/Cas system
MAKINO, Shigeru1, GONDO, Yoichi1
1Mutagenesis and Genomics Team, RIKEN BioRes. Cent.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 407-407, 2015.
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3F-01 Heat-shock protein 90 is involved in the regulation of retrotransposons in mouse male germ cells
ICHIYANAGI, Kenji1, ICHIYANAGI, Tomoko2, OGAWA, Ayako1, KURAMOCHI-MIYAGAWA, Satomi3, NAKANO, Toru3, CHUMA, Shinichiro4, SASAKI, Hiroyuki1, UDONO, Heiichiro2
1Div. Epigenomics and Dev., Med. Inst. Bioregulation, Kyushu Univ., 2Dept. Immun., Grad. Sch. Med., Dentistry, and Pharmaceutical Sci.s, Okayama Univ., 3Dept. Pathology, Medical School and Grad. Sch. Front. BioSci., Osaka Univ., 4Dept. Dev. Diff., Inst. Front. Med. Sci., Kyoto Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 407-407, 2015.
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3F-02 Mechanism of genome diversification by amplification of SINEs with the CTCF binding site
TSUKUI, Takahiro1,2, KUROKAWA, Ken2, NISHIHARA, Hidenori2, HIRAKAWA, Mika3, OKADA, Norihiro1
1Foundation for Advancement of InterNatl. Sci. (FAIS), 2Tokyo Inst. Tech., 3Biohistory Res. Hall
Genes & Genetic Systems 90 (6) 407-407, 2015.
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3F-03 Transposable elements acting as cis-regulatory elements in mammary gland development
NISHIHARA, Hidenori1
1Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 408-408, 2015.
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3F-04 Analysis of DNA methylaiton of the newly inserted LINE elements in zebrafish
YAMAGUCHI, Katsumi1, KAJIKAWA, Masaki1
1Grad. Sch. BioSci. and BioTech., Tokyo Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 408-408, 2015.
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3F-05 Analysis of transcriptional regulation of heat-activated retrotransposon in ecotypes of Arabidopsis thaliana
NOZAWA, Kosuke1, MASUDA, Seiji1, KATO, Atsushi2, ITO, Hidetaka2
1Grad. Sch. Life Sci., Hokkaido Univ., 2Faclt. Sci., Hokkaido Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 408-408, 2015.
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3F-06 The active MITE mPing produces transcriptional variants post-transcriptionally in the rice genome
KUM, Rise1, TSUKIYAMA, Takuji1, INAGAKI, Haruka1, SAITO, Hiroki1, TERAISHI, Masayoshi1, OKUMOTO, Yutaka1, TANISAKA, Takatoshi1,2
1Div. Agronomy and Horticulture Sci., Grad. Sch. Agr., Kyoto Univ., 2Dept. Agr. for Regional Reclamation, Kibi InterNatl. Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 408-408, 2015.
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3F-07 Evolution of the Au SINE retrotransposon in plant genomes
FAWCETT, Jeffrey1, INNAN, Hideki1
1SOKENDAI
Genes & Genetic Systems 90 (6) 409-409, 2015.
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3F-08 Chromosome substitution strains of medaka fish
SAKAIZUMI, Mitsuru1, MYOSHO, Taijun1, SATO, Tadashi1
1Inst. Sci. Technol., Niigata Univ.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 409-409, 2015.
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3F-09 Functional analyses of vertebrate ultraconserved elements in humanized fruit flies
OHSAKO, Takashi1, MATSUDA, Takeru2, TOMARU, Masatoshi3, TAKANO, Toshiyuki3
1Adv. Tech. Cent., Kyoto Inst. Tech., 2Dept. Appl. Biol., Kyoto Inst. Tech., 3Dept. Dros. Genomics Genet. Res., Kyoto Inst. Tech.
Genes & Genetic Systems 90 (6) 409-409, 2015.
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