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Biophysics and Physicobiology 19巻 - 号

発行元
日本生物物理学会
ISSN
ISSN(オンライン)
2189-4779
旧名・別名
BIOPHYSICS
前雑誌
BIOPHYSICS

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開始頁
Structural diversity of cysteine desulfurases involved in iron-sulfur cluster biosynthesis
Takashi Fujishiro, Ryosuke Nakamura, Kouhei Kunichika, Yasuhiro Takahashi
Department of Biochemistry and Molecular Biology, Graduate School of Science and Engineering, Saitama University
Biophysics and Physicobiology 19 e190001-1-e190001-18, 2022.
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Information quantity for secondary structure propensities of protein subsequences in the Protein Data Bank
Ryohei Kondo1, Kota Kasahara2, Takuya Takahashi2
1Graduate School of Life Sciences, Ritsumeikan University, 2College of Life Sciences, Ritsumeikan University
Biophysics and Physicobiology 19 e190002-1-e190002-12, 2022.
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Ionic strength-sensitive and pH-insensitive interactions between C-reactive protein (CRP) and an anti-CRP antibody
Yuka Oka1, Shota Ushiba1, Naruto Miyakawa1, Madoka Nishio1, Takao Ono2,3, Yasushi Kanai2, Yohei Watanabe4, Shinsuke Tani1, Masahiko Kimura1, Kazuhiko Matsumoto2
1Murata Manufacturing Co., Ltd., 2SANKEN, Osaka University, 3JST, PRESTO, 4Department of Infectious Diseases, Graduate School of Medical Science, Kyoto Prefectural University of Medicine
Biophysics and Physicobiology 19 e190003_1-e190003_9, 2022.
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A variety of photoreceptors and the frontiers of optogenetics
Satoru Tokutomi1,2,3, Satoshi P. Tsunoda4
1PRESTO, Japan Science and Technology Agency, 2Osaka Prefecture University, 3Botanical Gardens, Tohoku University, 4Department of Life Science and Applied Chemistry, Nagoya Institute of Technology
Biophysics and Physicobiology 19 e190004_1-e190004_3, 2022.
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How evolution builds up complexity? : In vitro evolution approaches to witness complexification in artificial molecular replication systems
Taro Furubayashi1,2, Norikazu Ichihashi3,4,5
1Department of Applied Chemistry, School of Engineering, The University of Tokyo, 2Japan Society for the Promotion of Science, 3Komaba Institute for Science, The University of Tokyo, 4Department of Life Science, Graduate School of Arts and Science, The University of Tokyo, 5Research Center for Complex Systems Biology, Universal Biology Institute, The University of Tokyo
Biophysics and Physicobiology 19 e190005_1-e190005_10, 2022.
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Quantitative and kinetic single-molecule analysis of DNA unwinding by Escherichia coli UvrD helicase
Hiroaki Yokota
The Graduate School for the Creation of New Photonics Industries
Biophysics and Physicobiology 19 e190006_1-e190006_16, 2022.
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Triple-color single-molecule imaging for analysis of the role of receptor oligomers in signal transduction
Hideaki Yoshimura
Department of Chemistry, School of Science, The University of Tokyo
Biophysics and Physicobiology 19 e190007_1-e190007_9, 2022.
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Slow and temperature-compensated autonomous disassembly of KaiB-KaiC complex
Damien Simon1,2, Atsushi Mukaiyama1,2, Yoshihiko Furuike1,2, Shuji Akiyama1,2
1Research Center of Integrative Molecular Systems (CIMoS), Institute for Molecular Science, National Institutes of Natural Sciences, 2Department of Functional Molecular Science, SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies)
Biophysics and Physicobiology 19 e190008_1-e190008_11, 2022.
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Current status of neutron crystallography in structural biology
Fumiaki Kono, Kazuo Kurihara, Taro Tamada
Institute for Quantum Life Science, National Institutes for Quantum Science and Technology
Biophysics and Physicobiology 19 e190009_1-e190009_10, 2022.
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Molecular dynamics simulations of amyloid-β peptides in heterogeneous environments
Yuhei Tachi1,2, Satoru G. Itoh2,3,4, Hisashi Okumura2,3,4
1Department of Physics, Graduate school of Science, Nagoya University, 2Institute, for Molecular Science, National Institutes of Natural Sciences, 3Exploratory Research Center on Life and Living Systems (ExCELLS), National Institutes of Natural Sciences, 4Department of Structural Molecular Science, SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies)
Biophysics and Physicobiology 19 e190010_1-e190010_18, 2022.
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Phenotypic systems biology for organisms : Concepts, methods and case studies
Takao K. Suzuki
Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, the University of Tokyo
Biophysics and Physicobiology 19 e190011_1-e190011_17, 2022.
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Mathematical model of chromosomal dynamics during DNA double strand break repair in budding yeast
Shinjiro Nakahata1, Tetsushi Komoto1, Masashi Fujii1, Akinori Awazu1,2
1Graduate School of Integrated Sciences, for Life, Hiroshima University, 2Research Center for the Mathematics on Chromatin Live Dynamics, Hiroshima University
Biophysics and Physicobiology 19 e190012_1-e190012_12, 2022.
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Recent advances in single-molecule spectroscopy studies on light-harvesting processes in oxygenic photosynthesis
Toru Kondo1,2, Yutaka Shibata3
1School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, 2PRESTO, Japan Science and Technology Agency, 3Department of Chemistry, Graduate School of Science, Tohoku University
Biophysics and Physicobiology 19 e190013_1-e190013_16, 2022.
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Dorsolateral prefrontal cortex sensing analgesia
Etsuro Ito1,3,4, Kotaro Oka2,3,4, Fusako Koshikawa5
1Department of Biology, Waseda University, 2Department of Bioscience and Informatics, Keio University, 3Waseda Research Institute for Science and Engineering, Waseda University, 4Graduate Institute of Medicine, Kaohsiung Medical University, 5Department of Psychology, Waseda University
Biophysics and Physicobiology 19 e190014_1-e190014_10, 2022.
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Coarse-grained molecular dynamics simulations of base-pair mismatch recognition protein MutS sliding along DNA
Keisuke Inoue, Shoji Takada, Tsuyoshi Terakawa
Department of Biophysics, Graduate School of Science, Kyoto University
Biophysics and Physicobiology 19 e190015_1-e190015_16, 2022.
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Practical considerations for feature assignment in high-speed AFM of live cell membranes
Damien Hall1,2, Adam S.Foster1,2
1WPI Nano Life Science Institute, Kanazawa University, 2Department of Applied Physics, Aalto University
Biophysics and Physicobiology 19 e190016_1-e190016_21, 2022.
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Multistep growth of amyloid intermediates and its inhibition toward exploring therapeutic way : A case study using insulin B chain and fibrinogen
Naoki Yamamoto1, Eri Chatani2
1School of Medicine, Jichi Medical University, 2Graduate School of Science, Kobe University
Biophysics and Physicobiology 19 e190017_1-e190017_10, 2022.
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Epigenetic-structural changes in X chromosomes promote Xic pairing during early differentiation of mouse embryonic stem cells
Tetsushi Komoto1, Masashi Fujii1, Akinori Awazu1,2
1Graduate School of Integrated Sciences for Life, Hiroshima University, 2Research Center for the Mathematics on Chromatin Live Dynamics, Hiroshima University
Biophysics and Physicobiology 19 e190018_1-e190018_14, 2022.
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Structures of oxygen dissociation intermediates of 400 kDa V2 hemoglobin provide coarse snapshots of the protein allostery
Nobutaka Numoto1, Seiko Onoda2, Yoshiaki Kawano3, Hideo Okumura4, Seiki Baba4, Yoshihiro Fukumori5, Kunio Miki6, Nobutoshi Ito1
1Medical Research Institute, Tokyo Medical and Dental University (TMDU), 2Graduate School of Natural Science and Technology, Kanazawa University, 3RIKEN SPring-8 Center, 4Structural Biology Division, Japan Synchrotron Radiation Research Institute, 5Nano Life Science Institute, Kanazawa University, 6Graduate School of Science, Kyoto University
Biophysics and Physicobiology 19 e190019_1-e190019_10, 2022.
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Exploring order in active turbulence: Geometric rule and pairing order transition in confined bacterial vortices
Kazusa Beppu, Yusuke T. Maeda
Department of Physics, Kyushu University
Biophysics and Physicobiology 19 e190020_1-e190020_9, 2022.
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Diverse reactions catalyzed by cytochrome P450 and biosynthesis of steroid hormone
Keisuke Fujiyama1, Tomoya Hino2,3, Shingo Nagano2,3
1Dormancy and Adaptation Research Unit, RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 2Center for Research on Green Sustainable Chemistry, Tottori University, 3Department of Chemistry and Biotechnology, Graduate School of Engineering, Tottori University
Biophysics and Physicobiology 19 e190021_1-e190021_16, 2022.
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Structural overview of the translocase of the mitochondrial outer membrane complex
Yuhei Araiso1, Toshiya Endo2,3
1Department of Clinical Laboratory Science, Division of Health Sciences, Graduate School of Medical Science, Kanazawa University, 2Faculty of Life Sciences, Kyoto Sangyo University, 3Institute for Protein Dynamics, Kyoto Sangyo University
Biophysics and Physicobiology 19 e190022_1-e190022_9, 2022.
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Current status and future perspectives of the evaluation of missense variants by using three-dimensional structures of proteins
Matsuyuki Shirota1,2, Kengo Kinoshita2,3
1Graduate School of Medicine, Tohoku University, 2Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, 3Graduate School of Information Sciences, Tohoku University
Biophysics and Physicobiology 19 e190023_1-e190023_7, 2022.
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Biophysical elucidation of neural network and chemical regeneration of neural tissue
Takahiro Muraoka1,2, Tomohide Saio3, Masaki Okumura4
1Department of Applied Chemistry, Graduate School of Engineering, Tokyo University of Agriculture and Technology, 2Kanagawa Institute of Industrial Science and Technology (KISTEC), 3Division of Molecular Life Science, Institute of Advanced Medical Sciences, Tokushima University, 4Frontier Research Institute for Interdisciplinary Sciences, Tohoku University
Biophysics and Physicobiology 19 e190024_1-e190024_2, 2022.
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Computational study of the impact of nucleotide variations on highly conserved proteins : In the case of actin
Ha T.T.Duong1,2, Hirofumi Suzuki3, Saki Katagiri1, Mayu Shibata1, Misae Arai1, Kei Yura1,3,4
1Graduate School of Humanities and Sciences, Ochanomizu University, 2Institute of Genome Research, Vietnam Academy of Science and Technology, 3Graduate School of Advanced Science and Engineering, Waseda University, 4Center for Interdisciplinary AI and Data Science, Ochanomizu University
Biophysics and Physicobiology 19 e190025_1-e190025_10, 2022.
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Simple dynamics underlying the survival behaviors of ciliates
Takuya Ohmura1, Yukinori Nishigami2, Masatoshi Ichikawa3
1Biozentrum, University of Basel, 2Research Institute for Electronic Science, Hokkaido University, 3Department of Physics, Kyoto University
Biophysics and Physicobiology 19 e190026_1-e190026_10, 2022.
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Molecular dynamics analysis of biomolecular systems including nucleic acids
Takeru Kameda1,2,3, Akinori Awazu4,5, Yuichi Togashi1,4,5,6,7
1College of Life Sciences, Ritsumeikan University, 2Graduate School of Science, Hiroshima University, 3RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), 4Graduate School of Integrated Sciences for Life, Hiroshima University, 5Research Center for the Mathematics on Chromatin Live Dynamics (RcMcD), Hiroshima University, 6RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), 7Cybermedia Center, Osaka University
Biophysics and Physicobiology 19 e190027_1-e190027_18, 2022.
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Phase separation by biopolymers : Basics and applications
Ryo Kitahara1, Tomoshi Kameda2
1College of Pharmaceutical Sciences, Ritsumeikan University, 2Artificial Intelligence Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST)
Biophysics and Physicobiology 19 e190028_1-e190028_2, 2022.
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A five-course meal symposium on "The Future of Muscle is Now"
Madoka Suzuki1, Kotaro Oyama2
1Institute for Protein Research, Osaka University, 2Quantum Beam Science Research Directorate, National Institutes for Quantum Science and Technology
Biophysics and Physicobiology 19 e190029_1-e190029_3, 2022.
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Japan-US symposium on motor proteins and associated single-molecule biophysics
Kumiko Hayashi1, Jakia Jannat Keya2,3
1Graduate School of Engineering, Tohoku University, 2Institute for Molecular Science, National Institutes of Natural Sciences, 3Medical School, University of Michigan
Biophysics and Physicobiology 19 e190030_1-e190030_3, 2022.
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Uncovering the design principles of supramolecular assemblies through manipulation of the structures, dynamics, and functions
Makito Miyazaki1,2,3,4, Takahiro Kosugi4,5,6,7
1The Hakubi Center for Advanced Research, Kyoto University, 2Department of Physics, Kyoto University, 3Institut Curie, PSL Research University, 4PRESTO, Japan Science and Technology Agency, 5Institute for Molecular Science (IMS), National Institutes of Natural Sciences (NINS), 6Exploratory Research Center on Life and Living Systems (ExCELLS), National Institutes of Natural Sciences (NINS), 7School of Physical Sciences, SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies)
Biophysics and Physicobiology 19 e190031_1-e190031_3, 2022.
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Zero-mode waveguides and nanopore-based sequencing technologies accelerate single-molecule studies
Ryo Iizuka, Hirohito Yamazaki, Sotaro Uemura
Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, The University of Tokyo
Biophysics and Physicobiology 19 e190032_1-e190032_19, 2022.
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Participation in 44th Indian Biophysical Society Meeting
Kayo Hibino1,2,3
1Laboratory of Genome Dynamics, National Institute of Genetics, 2Department of Genetics, School of Life Science, 3PRESTO, Japan Science and Technology Agency
Biophysics and Physicobiology 19 e190033_1-e190033_2, 2022.
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Quantum nanodiamonds for sensing of biological quantities : Angle, temperature, and thermal conductivity
Shingo Sotoma1, Hirotaka Okita1, Shunsuke Chuma1,2, Yoshie Harada1,3
1Institute for Protein Research, Osaka University, 2Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, Osaka University, 3Center for Quantum Information and Quantum Biology, Osaka University
Biophysics and Physicobiology 19 e190034_1-e190034_15, 2022.
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Protein large-scale motions revealed by quantum beams : A new era in understanding protein dynamics
Naoki Yamamoto1, Rintaro Inoue2, Ikuo Kurisaki3, Tatsuhito Matsuo4, Yuki Hishikawa5, Wenyang Zhao6, Hiroshi Sekiguchi7
1School of Medicine, Jichi Medical University, 2Institute for Integrated Radiation and Nuclear Science, Kyoto University, 3Graduate School of System Informatics, Kobe University, 4Institute for Quantum Life Science, National Institutes for Quantum Science and Technology, 5School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, 6Center for Computational Science, RIKEN, 7Japan Synchrotron Radiation Research Institute
Biophysics and Physicobiology 19 e190035_1-e190035_4, 2022.
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Interplay among cell migration, shaping, and traction force on a matrix with cell-scale stiffness heterogeneity
Hiroyuki Ebata1, Satoru Kidoaki2
1Department of Physics, Graduate School of Sciences, Kyushu University, 2Institute for Materials Chemistry and Engineering, Kyushu University
Biophysics and Physicobiology 19 e190036_1-e190036_16, 2022.
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Standardization of luminescence, fluorescence measurements, and light microscopy : Current situation and perspectives
Akira Sasaki1, Yoshihiro Ohmiya2,3
1Biomedical Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 2Biomedical Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 3Osaka Institute of Technology (OIT)
Biophysics and Physicobiology 19 e190037_1-e190037_3, 2022.
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Announcement of new Editorial Board members
Haruki Nakamura
Institute for Protein Research, Osaka University
Biophysics and Physicobiology 19 e190038_1-e190038_1, 2022.
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Tackle "Molecular Engine" by early-career researchers
Akihiro Otomo1,2, Takahiro Kosugi3,4,5,6
1Department of Life and Coordination-Complex Molecular Science, Institute for Molecular Science, National Institutes of Natural Sciences, 2Department of Functional Molecular Science, School of Physical Science, SOKENDAI, 3Research Center of Integrative Molecular Systems, Institute for Molecular Science, National Institutes of Natural Sciences, 4Exploratory Research Center on Life and Living Systems (ExCELLS), National Institutes of Natural Sciences, 5Department of Structural Molecular Science, School of Physical Sciences, SOKENDAI, 6PRESTO, Japan Science and Technology Agency
Biophysics and Physicobiology 19 e190039_1-e190039_3, 2022.
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Investigation on substrate specificity and catalytic activity of serine protease neuropsin
Masami Lintuluoto1, Mitsumasa Abe1, Yota Horioka1, Yoshifumi Fukunishi2, Hideki Tamura3,4, Juha M.Lintuluoto5
1Graduate School of Life and Environmental Sciences, Kyoto Prefectural University, 2Cellular and Molecular Biotechnology Research Institute, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), 3Laboratory of Biofunctional Science, Hoshi University School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, 4Institute for Advanced Life Sciences, Hoshi University School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, 5Graduate School of Engineering, Department of Synthetic and Biologica Chemistry, Kyoto University
Biophysics and Physicobiology 19 e190040_1-e190040_14, 2022.
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Influence of gap junctions upon Ca2+ propagation from stimulated keratinocytes to DRG neurons
Chiaki Seto1, Kenta Toyoda1, Kousuke Inada1, Kotaro Oka2,3,4, Etsuro Ito1,3,4
1Department of Biology, Waseda University, 2Department of Biosciences and Informatics, Faculty of Science and Technology, Keio University, 3Waseda Research Institute for Science and Engineering, Waseda University, 4Graduate Institute of Medicine, Kaohsiung Medical University
Biophysics and Physicobiology 19 e190041_1-e190041_10, 2022.
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Announcement of BPPB paper awards 2022
Haruki Nakamura
Editor-in-Chief of BPPB, Institute for Protein Research, Osaka University
Biophysics and Physicobiology 19 e190042_1-e190042_1, 2022.
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Creation of supramolecular biomembrane by the bottom-up self-assembly : Where material science meets biophysics
Kazuma Yasuhara1,2, Kenichi Morigaki3,4
1Division of Materials Science, Graduate School of Science and Technology, Nara Institute of Science and Technology, 2Center for Digital Green-innovation, Nara Institute of Science and Technology, 3Biosignal Research Center, Kobe University, 4Graduate School of Agricultural Science, Kobe University
Biophysics and Physicobiology 19 e190043_1-e190043_5, 2022.
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Physico- and chemical biology using nanomanipulation and micromanipulation technologies
Akira Kitamura1,2, Ryo Iizuka3
1Laboratory of Molecular Cell Dynamics, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, 2PRIME, Japan Agency for Medical Research and Development, 3Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, The University of Tokyo
Biophysics and Physicobiology 19 e190044_1-e190044_3, 2022.
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Development of the force field for cyclosporine A
Tsutomu Yamane1,2, Toru Ekimoto1, Mitsunori Ikeguchi1,2
1Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 2HPC- and AI-driven Drug Development Platform Division, Center for Computational Science, RIKEN
Biophysics and Physicobiology 19 e190045_1-e190045_12, 2022.
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Activation mechanism of the bacterial flagellar dual-fuel protein export engine
Tohru Minamino1, Miki Kinoshita1, Yusuke V.Morimoto2,3, Keiichi Namba1,4,5
1Graduate school of Frontier Biosciences, Osaka University, 2Department of Physics and Information Technology, Faculty of Computer Science and Systems Engineering, Kyushu Institute of Technology, 3Precursory Research for Embryonic Science and Technology, Japan Science and Technology Agency, 4RIKEN SPring-8 Center, 5JEOL YOKOGUSHI Research Alliance Laboratories, Osaka University
Biophysics and Physicobiology 19 e190046_1-e190046_13, 2022.
  • アブストラクト: 従量制は110円(税込)、基本料金制は基本料金に含まれます。
  • 全文ダウンロード: 従量制、基本料金制の方共に770円(税込) です。
Live-cell imaging of bio-metal species
Tasuku Hirayama1, Koichiro Ishimori2
1Laboratory of Pharmaceutical and Medicinal Chemistry, Gifu Pharmaceutical University, 2Department of Chemistry, Faculty of Science, Hokkaido University
Biophysics and Physicobiology 19 e190047_1-e190047_3, 2022.
  • アブストラクト: 従量制は110円(税込)、基本料金制は基本料金に含まれます。
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Intestinal and optic-cup organoids as tools for unveiling mechanics of self-organizing morphogenesis
Sristilekha Nath, Satoshi Toda, Satoru Okuda
WPI-Nano Life Science Institute (NanoLSI), Kanazawa University
Biophysics and Physicobiology 19 e190048_1-e190048_11, 2022.
  • アブストラクト: 従量制は110円(税込)、基本料金制は基本料金に含まれます。
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